RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538258.1

PGA3-204, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PGA3, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-204ENST00000538258 EYA2O00167 538 aa11.3□□□□□ -0.6
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PGA3-204ENST00000538258 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PGA3-204ENST00000538258 KLRK1P26718 216 aa11.3□□□□□ -0.6
PGA3-204ENST00000538258 MTX1Q13505 466 aa11.3□□□□□ -0.6
PGA3-204ENST00000538258 PDE3AQ14432 1141 aa11.3□□□□□ -0.6
PGA3-204ENST00000538258 MVPQ14764 893 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PGA3-204ENST00000538258 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.3□□□□□ -0.6
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PGA3-204ENST00000538258 C20orf194Q5TEA3 1177 aa11.29□□□□□ -0.6
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PGA3-204ENST00000538258 USP17L1Q7RTZ2 530 aa11.26□□□□□ -0.61
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PGA3-204ENST00000538258 CEP85Q6P2H3 762 aa11.25□□□□□ -0.61
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PGA3-204ENST00000538258 VPS37DQ86XT2 251 aa11.25□□□□□ -0.61
PGA3-204ENST00000538258 SSH3Q8TE77 659 aa11.25□□□□□ -0.61
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PGA3-204ENST00000538258 H7C1D1 291 aa11.24□□□□□ -0.61
PGA3-204ENST00000538258 IL1R1P14778 569 aa11.24□□□□□ -0.61
PGA3-204ENST00000538258 FGFR2P21802 821 aa11.24□□□□□ -0.61
PGA3-204ENST00000538258 GTF2IP78347 998 aa11.24□□□□□ -0.61
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PGA3-204ENST00000538258 CAVIN4Q5BKX8 364 aa11.24□□□□□ -0.61
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PGA3-204ENST00000538258 TTLL5Q6EMB2 1281 aa11.24□□□□□ -0.61
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PGA3-204ENST00000538258 SHTN1A0MZ66 631 aa11.23□□□□□ -0.61
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PGA3-204ENST00000538258 DACT2Q5SW24 774 aa11.23□□□□□ -0.61
PGA3-204ENST00000538258 CHADLQ6NUI6 762 aa11.23□□□□□ -0.61
PGA3-204ENST00000538258 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PGA3-204ENST00000538258 LDHDQ86WU2 507 aa11.23□□□□□ -0.61
PGA3-204ENST00000538258 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.23□□□□□ -0.61
PGA3-204ENST00000538258 MXD3Q9BW11 206 aa11.23□□□□□ -0.61
PGA3-204ENST00000538258 ZNF609O15014 1411 aa11.22□□□□□ -0.61
PGA3-204ENST00000538258 HMMRO75330 724 aa11.22□□□□□ -0.61
PGA3-204ENST00000538258 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
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