RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534967.1

GOLGA3-204, Transcript of golgin A3, human

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 484 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GOLGA3-204	ENST00000534967	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		33.96	■■■■□ 3.03
GOLGA3-204	ENST00000534967	GREM2	Q9H772	168 aa		33.96	■■■■□ 3.03
GOLGA3-204	ENST00000534967	SPEF2	Q9C093	1822 aa		33.95	■■■■□ 3.03
GOLGA3-204	ENST00000534967	TSPYL6	Q8N831	410 aa		33.95	■■■■□ 3.03
GOLGA3-204	ENST00000534967	FBXW7	Q969H0	707 aa		33.95	■■■■□ 3.03
GOLGA3-204	ENST00000534967	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	33.95	■■■■□ 3.03
GOLGA3-204	ENST00000534967	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		33.94	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	DACT2	Q5SW24	774 aa		33.94	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	KSR2	Q6VAB6	950 aa		33.94	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		33.94	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	33.94	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	33.92	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	33.92	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		33.92	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	OGFOD1	Q8N543	542 aa		33.91	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		33.91	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	MYH3	P11055	1940 aa		33.91	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	33.9	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	33.9	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	WNT10B	O00744	389 aa		33.89	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	TBC1D8	O95759	1140 aa		33.89	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		33.89	■■■■□ 3.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		33.88	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		33.88	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	COA1	Q9GZY4	146 aa		33.88	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		33.88	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		33.87	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	SASH1	O94885	1247 aa		33.87	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	33.87	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		33.87	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		33.86	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	33.86	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	33.86	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	NF2	P35240	595 aa		33.85	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		33.85	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	STK31	Q9BXU1	1019 aa		33.85	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		33.85	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	33.84	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967		H7C1W4	665 aa		33.83	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	KLRK1	P26718	216 aa		33.83	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	TM4SF4	P48230	202 aa		33.83	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	G2E3	Q7L622	706 aa		33.83	■■■■□ 3.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		33.81	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	PRKG1	Q13976	671 aa		33.81	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	33.81	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		33.81	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		33.81	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	33.8	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	GPR25	O00155	361 aa		33.79	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	ITGA6	P23229	1130 aa		33.79	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	GTF2I	P78347	998 aa		33.78	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		33.78	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		33.78	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	MMP14	P50281	582 aa		33.77	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	SREBF2	Q12772	1141 aa		33.77	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		33.77	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		33.77	■■■■□ 3
GOLGA3-204	ENST00000534967	SLC4A2	P04920	1241 aa		33.76	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	GCKR	Q14397	625 aa		33.76	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	33.76	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	KCNJ4	P48050	445 aa		33.74	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	CASP7	P55210	303 aa		33.74	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		33.74	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	FZD1	Q9UP38	647 aa		33.74	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	CHRND	Q07001	517 aa		33.73	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		33.73	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	CSF1R	P07333	972 aa		33.72	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	SPRYD7	Q5W111	196 aa		33.72	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	CD209	Q9NNX6	404 aa		33.72	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		33.72	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	SNAP23	O00161	211 aa		33.7	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	FKTN	O75072	461 aa		33.7	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	FLII	Q13045	1269 aa		33.7	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		33.7	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		33.7	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	DLGAP5	Q15398	846 aa		33.69	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	WWC1	Q8IX03	1113 aa		33.69	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	CERS5	Q8N5B7	392 aa		33.69	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		33.69	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	33.68	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	33.68	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	CCDC27	Q2M243	656 aa		33.67	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		33.67	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		33.67	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		33.66	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	TAF5L	O75529	589 aa		33.66	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	LINS1	Q8NG48	757 aa		33.66	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	CCDC184	Q52MB2	194 aa		33.65	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		33.65	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		33.64	■■■□□ 2.98
GOLGA3-204	ENST00000534967		F8W031	263 aa	Predicted RBP	33.64	■■■□□ 2.98

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