RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RBM4B-208	ENST00000534198	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM4B-208	ENST00000534198	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	FKTN	O75072	461 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	GOLGA2	Q08379	1002 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	SPRYD7	Q5W111	196 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	GREM2	Q9H772	168 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	FZD1	Q9UP38	647 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198		H7C1W4	665 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	KLRK1	P26718	216 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	CTSW	P56202	376 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	CAP1	Q01518	475 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	MAP3K11	Q16584	847 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	POTEF	A5A3E0	1075 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	SASH1	O94885	1247 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	MMP14	P50281	582 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	TSPYL6	Q8N831	410 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	IFT57	Q9NWB7	429 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	CASP7	P55210	303 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	SREBF2	Q12772	1141 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	PRKG1	Q13976	671 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	IFNL1	Q8IU54	200 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	OGFOD1	Q8N543	542 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	CERS5	Q8N5B7	392 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	APAF1	O14727	1248 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	CSF1R	P07333	972 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	GJA5	P36382	358 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	INHBE	P58166	350 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	AOX1	Q06278	1338 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	PTPN18	Q99952	460 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	HTT	P42858	3142 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	SNAP23	O00161	211 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	NF2	P35240	595 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	GNAI1	P63096	354 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	GTF2I	P78347	998 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	G2E3	Q7L622	706 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIM17	Q9Y577	477 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM4B-208	ENST00000534198	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	WNK4	Q96J92	1243 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	UNCX	A6NJT0	531 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	FBXW7	Q969H0	707 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	ARMC5	Q96C12	935 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	ITGA6	P23229	1130 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	CHRND	Q07001	517 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	GCKR	Q14397	625 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	DLGAP5	Q15398	846 aa		11.18	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms