RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-222	ENST00000532751	PANK1	Q8TE04	598 aa		27.37	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		27.37	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		27.37	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	SNAP23	O00161	211 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	27.36	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	KLRK1	P26718	216 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	MTX1	Q13505	466 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	SRGAP3	O43295	1099 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	EPS15	P42566	896 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	DPF2	Q92785	391 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	USP17L3	A6NCW0	530 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	USP17L4	A6NCW7	530 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	27.34	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	LDHD	Q86WU2	507 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	27.34	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	27.33	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	CIAO1	O76071	339 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	PDE8B	O95263	885 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	SIL1	Q9H173	461 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	COPRS	Q9NQ92	184 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.33	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751		H7C1D1	291 aa		27.32	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	CHADL	Q6NUI6	762 aa		27.32	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	27.32	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	FBXW7	Q969H0	707 aa		27.32	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	CD209	Q9NNX6	404 aa		27.32	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	27.32	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		27.31	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	POTEI	P0CG38	1075 aa		27.31	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	POTEJ	P0CG39	1038 aa		27.31	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	27.31	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		27.31	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		27.31	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	27.3	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	27.3	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		27.3	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	MICALL2	Q8IY33	904 aa		27.3	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	27.3	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	27.29	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		27.29	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	27.29	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		27.29	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF609	O15014	1411 aa		27.29	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	27.28	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		27.28	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	27.28	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	HSPA6	P17066	643 aa		27.28	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		27.28	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.28	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	IL1R1	P14778	569 aa		27.27	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	PDE3A	Q14432	1141 aa		27.27	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		27.27	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	COG6	Q9Y2V7	657 aa		27.27	■■□□□ 1.96
PTPRK-222	ENST00000532751	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		27.26	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	GTF2I	P78347	998 aa		27.26	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	ATP8B2	P98198	1209 aa		27.26	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		27.26	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	DACT2	Q5SW24	774 aa		27.26	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	VPS37D	Q86XT2	251 aa		27.26	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	SLC5A1	P13866	664 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	GYG1	P46976	350 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	LPIN2	Q92539	896 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.25	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	SHTN1	A0MZ66	631 aa		27.24	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	FGFR2	P21802	821 aa		27.24	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	27.23	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	GML	Q99445	158 aa		27.23	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	USP17L8	P0C7I0	530 aa		27.22	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	POLA2	Q14181	598 aa		27.22	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	ATP2B3	Q16720	1220 aa		27.22	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		27.22	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.22	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		27.22	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	SASH1	O94885	1247 aa		27.21	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	27.21	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.21	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	SSH3	Q8TE77	659 aa		27.21	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	27.21	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		27.21	■■□□□ 1.95
PTPRK-222	ENST00000532751	MMP14	P50281	582 aa		27.2	■■□□□ 1.94
PTPRK-222	ENST00000532751	APLP1	P51693	650 aa		27.2	■■□□□ 1.94
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	27.2	■■□□□ 1.94
PTPRK-222	ENST00000532751	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	27.2	■■□□□ 1.94
PTPRK-222	ENST00000532751	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	27.2	■■□□□ 1.94
PTPRK-222	ENST00000532751	CNTROB	Q8N137	903 aa		27.2	■■□□□ 1.94
PTPRK-222	ENST00000532751	OGFOD1	Q8N543	542 aa		27.2	■■□□□ 1.94
PTPRK-222	ENST00000532751	MXD3	Q9BW11	206 aa		27.2	■■□□□ 1.94
PTPRK-222	ENST00000532751	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	27.19	■■□□□ 1.94
PTPRK-222	ENST00000532751	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	27.19	■■□□□ 1.94
PTPRK-222	ENST00000532751	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		27.19	■■□□□ 1.94
PTPRK-222	ENST00000532751	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		27.19	■■□□□ 1.94
PTPRK-222	ENST00000532751	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		27.19	■■□□□ 1.94
PTPRK-222	ENST00000532751	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		27.19	■■□□□ 1.94
PTPRK-222	ENST00000532751	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	27.18	■■□□□ 1.94
PTPRK-222	ENST00000532751	CEP85	Q6P2H3	762 aa		27.18	■■□□□ 1.94

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