RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 USP17L4A6NCW7 530 aa23.98■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 G3V3G9 751 aa23.98■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 DACT2Q5SW24 774 aa23.98■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.98■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.98■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.98■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 AOC2O75106 756 aa23.97■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.96■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 LBX1P52954 281 aa23.96■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 MXD3Q9BW11 206 aa23.96■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 GRM8O00222 908 aa23.95■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 CHRNDQ07001 517 aa23.95■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 GRM1Q13255 1194 aa23.95■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.95■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.95■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 COA1Q9GZY4 146 aa23.95■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.94■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.94■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 SNAP23O00161 211 aa23.94■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 USP17L8P0C7I0 530 aa23.94■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 MAP2K2P36507 400 aa23.94■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.94■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.93■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 KAZALD1Q96I82 304 aa23.93■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.92■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 ALDH1L1O75891 902 aa23.92■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 HUNKP57058 714 aa23.92■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 SCARF1Q14162 830 aa23.92■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.92■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.92■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.91■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 ZIC5Q96T25 663 aa23.91■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.9■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 SULF1Q8IWU6 871 aa23.9■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 CDCA5Q96FF9 252 aa23.9■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 UTYO14607 1347 aa23.89■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.89■■□□□ 1.42
CTTN-211ENST00000527622 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 TAF5LO75529 589 aa23.89■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.89■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.88■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 E9PSI1 815 aa23.88■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 CAPN15O75808 1086 aa23.88■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 SLFN5Q08AF3 891 aa23.88■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.88■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.88■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 SUCLG2Q96I99 432 aa23.88■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 CD209Q9NNX6 404 aa23.88■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.87■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 WNT10BO00744 389 aa23.86■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 NOGQ13253 232 aa23.86■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.86■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 RGMBQ6NW40 437 aa23.86■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.86■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 KCNJ4P48050 445 aa23.85■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 GTF2IP78347 998 aa23.85■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 CERS5Q8N5B7 392 aa23.85■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.85■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 FBXW7Q969H0 707 aa23.85■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 TSKSQ9UJT2 592 aa23.85■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.84■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.84■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 PTPRCP08575 1304 aa23.84■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 SASH1O94885 1247 aa23.83■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 IL1R1P14778 569 aa23.83■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.83■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.83■■□□□ 1.41
CTTN-211ENST00000527622 SLC10A3P09131 477 aa23.82■■□□□ 1.4
CTTN-211ENST00000527622 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.82■■□□□ 1.4
CTTN-211ENST00000527622 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.82■■□□□ 1.4
CTTN-211ENST00000527622 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
CTTN-211ENST00000527622 CA12O43570 354 aa23.81■■□□□ 1.4
CTTN-211ENST00000527622 MMP14P50281 582 aa23.81■■□□□ 1.4
CTTN-211ENST00000527622 OGFOD1Q8N543 542 aa23.81■■□□□ 1.4
CTTN-211ENST00000527622 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
CTTN-211ENST00000527622 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.8■■□□□ 1.4
CTTN-211ENST00000527622 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CTTN-211ENST00000527622 FKBP1BP68106 108 aa23.79■■□□□ 1.4
CTTN-211ENST00000527622 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.79■■□□□ 1.4
CTTN-211ENST00000527622 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.79■■□□□ 1.4
CTTN-211ENST00000527622 MOB2Q70IA6 237 aa23.79■■□□□ 1.4
CTTN-211ENST00000527622 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.79■■□□□ 1.4
CTTN-211ENST00000527622 CCDC102AQ96A19 550 aa23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms