RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525939.1

ABCA7-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 7, human

TSL 3

Gene ABCA7, Length 374 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA7-208	ENST00000525939	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	FBXO3	Q9UK99	471 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	KLRK1	P26718	216 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	APLP1	P51693	650 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	MTX1	Q13505	466 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	USP17L3	A6NCW0	530 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	USP17L4	A6NCW7	530 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	SNAP23	O00161	211 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	LRRC24	Q50LG9	513 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	GML	Q99445	158 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939		H7C1D1	291 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	EYA2	O00167	538 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	RLBP1	P12271	317 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	MICALL2	Q8IY33	904 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	CD209	Q9NNX6	404 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	PLIN1	O60240	522 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	CIAO1	O76071	339 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	PDE8B	O95263	885 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	GNAI2	P04899	355 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	IL1R1	P14778	569 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	PASK	Q96RG2	1323 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	MS4A1	P11836	297 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	METTL24	Q5JXM2	366 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	DACT2	Q5SW24	774 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	COPRS	Q9NQ92	184 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ABCA7-208	ENST00000525939	MMP14	P50281	582 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	SHTN1	A0MZ66	631 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	CNTROB	Q8N137	903 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	FGFR2	P21802	821 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	SRGAP3	O43295	1099 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	USP17L8	P0C7I0	530 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	GTF2I	P78347	998 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	SASH1	O94885	1247 aa		27.64	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
ABCA7-208	ENST00000525939	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		27.64	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		27.64	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	EGFR	P00533	1210 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	GYG1	P46976	350 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	PANK1	Q8TE04	598 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	SIL1	Q9H173	461 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	LPIN2	Q92539	896 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	MXD3	Q9BW11	206 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	CREBZF	Q9NS37	354 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	ATP8B2	P98198	1209 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	POLA2	Q14181	598 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	OGFOD1	Q8N543	542 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	FBXW7	Q969H0	707 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	ZBTB22	O15209	634 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	SLC5A1	P13866	664 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	PDE3A	Q14432	1141 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	SSH3	Q8TE77	659 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ABCA7-208	ENST00000525939	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		27.58	■■■□□ 2.01

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