RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524681.1

CTSW-202, Transcript of cathepsin W, humanhuman

TSL 2

Gene CTSW, Length 521 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-202ENST00000524681 XAGE2Q96GT9 111 aa9.18□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.18□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 STAP2Q9UGK3 403 aa9.18□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 BCS1LQ9Y276 419 aa9.18□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 MED23Q9ULK4 1368 aa9.17□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 APBB1O00213 710 aa9.17□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 KCNA4P22459 653 aa9.17□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.17□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.17□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 ATP2B3Q16720 1220 aa9.17□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.17□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.17□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 UFL1O94874 794 aa9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 IL1R1P14778 569 aa9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 GYG1P46976 350 aa9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 BCAMP50895 628 aa9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 SCARF1Q14162 830 aa9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 SOGA3Q5TF21 947 aa9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 CCDC102BQ68D86 513 aa9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 AACSQ86V21 672 aa9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 PI4K2BQ8TCG2 481 aa9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 LNPKQ9C0E8 428 aa9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 VPS33BQ9H267 617 aa9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 KCNQ5Q9NR82 932 aa9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 GGA1Q9UJY5 639 aa9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.16□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 CHD4Q14839 1912 aa9.15□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 YDJCA8MPS7 323 aa9.15□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 PHKA1P46020 1223 aa9.15□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 PDE1AP54750 535 aa9.15□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 RASSF7Q02833 373 aa9.15□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 TAOK3Q9H2K8 898 aa9.15□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CTSW-202ENST00000524681 AKAP11Q9UKA4 1901 aa9.15□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 SCN9AQ15858 1988 aa9.14□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 SLC5A1P13866 664 aa9.14□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 ATP5JP18859 108 aa9.14□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 RASGRF1Q13972 1273 aa9.14□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 AOC3Q16853 763 aa9.14□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 WASHC4Q2M389 1173 aa9.14□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.14□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP9.14□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 CD209Q9NNX6 404 aa9.14□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 SBF1O95248 1867 aa9.14□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 C6orf229H3BNL8 230 aa9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 FZD9O00144 591 aa9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 RIMBP2O15034 1052 aa9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 MX1P20591 662 aa9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 MCAMP43121 646 aa9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 DOK7Q18PE1 504 aa9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 PI16Q6UXB8 463 aa9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 NEUROD6Q96NK8 337 aa9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 COA1Q9GZY4 146 aa9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 HMG20BQ9P0W2 317 aa9.13□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.12□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 FAM205AQ6ZU69 1335 aa9.12□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 GRIK5Q16478 980 aa9.12□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 CERS5Q8N5B7 392 aa9.12□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 SUPT20HQ8NEM7 779 aa9.12□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 ZNF384Q8TF68 577 aa9.12□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 HAUS7Q99871 368 aa9.12□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 AOX1Q06278 1338 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 SALL1Q9NSC2 1324 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 SEMA3EO15041 775 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 PPIP5K2O43314 1243 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 GRIN3BO60391 1043 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 LMNB1P20700 586 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 KCNJ4P48050 445 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 DACT2Q5SW24 774 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 PODNQ7Z5L7 613 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 SPATA5Q8NB90 893 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 GMLQ99445 158 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 EYA3Q99504 573 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 DBNDD1Q9H9R9 158 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 ZNRF3Q9ULT6 936 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.11□□□□□ -0.95
CTSW-202ENST00000524681 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms