RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524095.5

CLVS1-211, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLVS1, Length 709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-211ENST00000524095 USP17L4A6NCW7 530 aa9.66□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 WNT10BO00744 389 aa9.66□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 UFL1O94874 794 aa9.66□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 SREBF2Q12772 1141 aa9.66□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 PRKG1Q13976 671 aa9.66□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 KRT24Q2M2I5 525 aa9.66□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.66□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.66□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.66□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.66□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 GGA1Q9UJY5 639 aa9.66□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 FZD1Q9UP38 647 aa9.66□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 POTEMA6NI47 508 aa9.65□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 PODNQ7Z5L7 613 aa9.65□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 IFNL1Q8IU54 200 aa9.65□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 ARMC5Q96C12 935 aa9.65□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.65□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 NUP98P52948 1817 aa9.65□□□□□ -0.86
CLVS1-211ENST00000524095 A0A0C4DFX4 3053 aa9.64□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 ALDH1A1P00352 501 aa9.64□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 INHBEP58166 350 aa9.64□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 DACT2Q5SW24 774 aa9.64□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 ARMC9Q7Z3E5 817 aa9.64□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.64□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 H0YGN5 161 aa9.63□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 NEFMP07197 916 aa9.63□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 RIPK4P57078 832 aa9.63□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 CD99L2Q8TCZ2 262 aa9.63□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 PTPN18Q99952 460 aa9.63□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.63□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 COL4A1P02462 1669 aa9.63□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 CHL1O00533 1208 aa9.62□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 DLL1O00548 723 aa9.62□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 ATP2B4P23634 1241 aa9.62□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 NF2P35240 595 aa9.62□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.62□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 EFCC1Q9HA90 598 aa9.62□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF609O15014 1411 aa9.62□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 POTEB2H3BUK9 544 aa9.61□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 SASH1O94885 1247 aa9.61□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 GJA5P36382 358 aa9.61□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 MAP3K11Q16584 847 aa9.61□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 POTEGQ6S5H5 508 aa9.61□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.61□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 OGFOD1Q8N543 542 aa9.61□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 ERO1AQ96HE7 468 aa9.61□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 WNK4Q96J92 1243 aa9.61□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF333Q96JL9 665 aa9.61□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 SP3Q02447 781 aa9.6□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 CRHR2Q13324 411 aa9.6□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 STRIP1Q5VSL9 837 aa9.6□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.6□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 DEFB129Q9H1M3 183 aa9.6□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.6□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 XDHP47989 1333 aa9.59□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 PDE8AO60658 829 aa9.59□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.59□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.59□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.59□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.59□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.59□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 TAF1P21675 1872 aa9.59□□□□□ -0.87
CLVS1-211ENST00000524095 AKAP11Q9UKA4 1901 aa9.58□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa9.58□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 MMP14P50281 582 aa9.58□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.58□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.58□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 FBXW7Q969H0 707 aa9.58□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 HYPKQ9NX55 129 aa9.58□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa9.58□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 CCT4P50991 539 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms