RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516042.1

RNU6-772P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 772, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-772P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-772P-201ENST00000516042 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 TSPAN15O95858 294 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 EPHA1P21709 976 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 CLDN10P78369 228 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 PAOXQ6QHF9 649 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 SIAH1Q8IUQ4 282 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 STK11IPQ8N1F8 1099 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 TBC1D32Q96NH3 1257 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 PPP1R16BQ96T49 567 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 SEC31BQ9NQW1 1179 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC5A6Q9Y289 635 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 ATAD2Q6PL18 1390 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM177BA6PVY3 158 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 ABL2P42684 1182 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 ATP11AP98196 1134 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 DGKZQ13574 1117 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 CEP135Q66GS9 1140 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZAR1Q86SH2 424 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 WFDC3Q8IUB2 231 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 SHISA5Q8N114 240 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 SIX5Q8N196 739 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 GLIS3Q8NEA6 775 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 CSRNP1Q96S65 589 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 LRRC10BA6NIK2 292 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 MICAL2O94851 1124 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 NLRP12P59046 1061 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 NFKBIBQ15653 356 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 KLHDC7BQ96G42 594 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 USP20Q9Y2K6 914 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM170BA6NMN3 283 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 H3BRJ5 948 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 ADMP35318 185 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 PIP4K2BP78356 416 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 RGL4Q8IZJ4 473 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 LARGE2Q8N3Y3 721 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 OGFOD1Q8N543 542 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 WNT8BQ93098 351 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPACA7Q96KW9 195 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 GDPD2Q9HCC8 539 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 USP17L3A6NCW0 530 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 USP17L4A6NCW7 530 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 TIAF1O95411 115 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 INHBBP09529 407 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 PTPRAP18433 802 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 FUT4P22083 530 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 CTSWP56202 376 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 CYP27A1Q02318 531 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 ECM1Q16610 540 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 DUSP27Q5VZP5 1158 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 USP17L2Q6R6M4 530 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 USP17L1Q7RTZ2 530 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 ANKLE2Q86XL3 938 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 YIPF2Q9BWQ6 316 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 MEGF11A6BM72 1044 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 CABP4P57796 275 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 HYAL2Q12891 473 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 MLANAQ16655 118 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 NUTM2GQ5VZR2 741 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPRED2Q7Z698 418 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 NLRP13Q86W25 1043 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 LRRN4CLQ8ND94 238 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 FBLIM1Q8WUP2 373 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 GATA6Q92908 595 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 MISP3Q96FF7 219 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZMYND15Q9H091 742 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 RASSF4Q9H2L5 321 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 CYP4F12Q9HCS2 524 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 OSGEPQ9NPF4 335 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM53CQ9NYF3 392 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 KCNMB2Q9Y691 235 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-772P-201ENST00000516042 OPLAHO14841 1288 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-772P-201ENST00000516042 IGFBP4P22692 258 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-772P-201ENST00000516042 USP11P51784 963 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-772P-201ENST00000516042 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-772P-201ENST00000516042 CDPF1Q6NVV7 123 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF765Q7L2R6 523 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZSWIM9Q86XI8 627 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-772P-201ENST00000516042 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-772P-201ENST00000516042 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR13H1Q8NG92 308 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.1 ms