RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509677.5

SH3BP2-214, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-214ENST00000509677 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.68■■□□□ 1.22
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SH3BP2-214ENST00000509677 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-214ENST00000509677 SASH1O94885 1247 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-214ENST00000509677 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-214ENST00000509677 DACT2Q5SW24 774 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-214ENST00000509677 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.52■■□□□ 1.2
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SH3BP2-214ENST00000509677 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
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