RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506437.1

ITGA3-208, Transcript of integrin subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene ITGA3, Length 3,055 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGA3-208	ENST00000506437	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	PDE1A	P54750	535 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	MYH3	P11055	1940 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	MX1	P20591	662 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	KLRK1	P26718	216 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	ST5	P78524	1137 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437		A0A1B0GUL7	405 aa		13.77	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	TERF1	P54274	439 aa		13.77	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.77	□□□□□ -0.2
ITGA3-208	ENST00000506437	KCNJ4	P48050	445 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	CHRND	Q07001	517 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437		A0A0G2JLW4	131 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	SDS	P20132	328 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	SCARF1	Q14162	830 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	CCDC125	Q86Z20	511 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	GYG1	P46976	350 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	CASZ1	Q86V15	1759 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	BCAM	P50895	628 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	LAMB2	P55268	1798 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	PDE8B	O95263	885 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	PHKA1	P46020	1223 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	RIMBP2	O15034	1052 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	SRGN	P10124	158 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	CNPY4	Q8N129	248 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	IL25	Q9H293	177 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	CACNA1S	Q13698	1873 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ITGA3-208	ENST00000506437	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	GOLIM4	O00461	696 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	GRAP	Q13588	217 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	GPSM2	P81274	684 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	CIAO1	O76071	339 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	DPEP1	P16444	411 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437		H0YIN7	160 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	C6orf229	H3BNL8	230 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	C21orf2	O43822	256 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	CRY2	Q49AN0	593 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	MPND	Q8N594	471 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ITGA3-208	ENST00000506437	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22

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