RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
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SMIM20-201ENST00000506197 XDHP47989 1333 aa24.75■■□□□ 1.55
SMIM20-201ENST00000506197 COL4A5P29400 1685 aa24.75■■□□□ 1.55
SMIM20-201ENST00000506197 FZD9O00144 591 aa24.74■■□□□ 1.55
SMIM20-201ENST00000506197 JDP2Q8WYK2 163 aa24.74■■□□□ 1.55
SMIM20-201ENST00000506197 PDE8BO95263 885 aa24.73■■□□□ 1.55
SMIM20-201ENST00000506197 KCNJ4P48050 445 aa24.73■■□□□ 1.55
SMIM20-201ENST00000506197 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.73■■□□□ 1.55
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SMIM20-201ENST00000506197 BCL11AQ9H165 835 aa24.72■■□□□ 1.55
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SMIM20-201ENST00000506197 C6orf229H3BNL8 230 aa24.67■■□□□ 1.54
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SMIM20-201ENST00000506197 AOC3Q16853 763 aa24.65■■□□□ 1.54
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SMIM20-201ENST00000506197 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.65■■□□□ 1.54
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SMIM20-201ENST00000506197 EYA3Q99504 573 aa24.64■■□□□ 1.54
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SMIM20-201ENST00000506197 POLLQ9UGP5 575 aa24.64■■□□□ 1.54
SMIM20-201ENST00000506197 TIMM10P62072 90 aa24.63■■□□□ 1.53
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SMIM20-201ENST00000506197 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
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SMIM20-201ENST00000506197 MED23Q9ULK4 1368 aa24.61■■□□□ 1.53
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SMIM20-201ENST00000506197 WASHC4Q2M389 1173 aa24.6■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.6■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 JMYQ8N9B5 988 aa24.6■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 GPATCH3Q96I76 525 aa24.6■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.6■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 ADORA1P30542 326 aa24.59■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 VPS37DQ86XT2 251 aa24.59■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.59■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 RIMBP2O15034 1052 aa24.58■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 KLRK1P26718 216 aa24.58■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 SCNN1DP51172 638 aa24.58■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.58■■□□□ 1.53
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