RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502676.1

PITX1-202, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-202ENST00000502676 DPF2Q92785 391 aa29.1■■■□□ 2.25
PITX1-202ENST00000502676 USP17L3A6NCW0 530 aa29.09■■■□□ 2.25
PITX1-202ENST00000502676 USP17L4A6NCW7 530 aa29.09■■■□□ 2.25
PITX1-202ENST00000502676 H7C1D1 291 aa29.09■■■□□ 2.25
PITX1-202ENST00000502676 METTL24Q5JXM2 366 aa29.09■■■□□ 2.25
PITX1-202ENST00000502676 USP17L1Q7RTZ2 530 aa29.09■■■□□ 2.25
PITX1-202ENST00000502676 MICALL2Q8IY33 904 aa29.09■■■□□ 2.25
PITX1-202ENST00000502676 FBXW7Q969H0 707 aa29.09■■■□□ 2.25
PITX1-202ENST00000502676 APLP1P51693 650 aa29.08■■■□□ 2.25
PITX1-202ENST00000502676 SCN9AQ15858 1988 aa29.08■■■□□ 2.25
PITX1-202ENST00000502676 A0A1B0GUL6 1792 aa29.07■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 UBE4AQ14139 1066 aa29.07■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 SHTN1A0MZ66 631 aa29.06■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 ZNF804AQ7Z570 1209 aa29.06■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 ITPRIPQ8IWB1 547 aa29.06■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.06■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 GNAI2P04899 355 aa29.05■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa29.04■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 IRS2Q9Y4H2 1338 aa29.04■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 EYA2O00167 538 aa29.04■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 RLBP1P12271 317 aa29.04■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 AGBL3Q8NEM8 1001 aa29.04■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 CD209Q9NNX6 404 aa29.04■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 SIL1Q9H173 461 aa29.03■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 PDE8BO95263 885 aa29.02■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 STRIP1Q5VSL9 837 aa29.02■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 TTLL5Q6EMB2 1281 aa29.02■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 CNTROBQ8N137 903 aa29.02■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 TRPM4Q8TD43 1214 aa29.02■■■□□ 2.24
PITX1-202ENST00000502676 SRGAP3O43295 1099 aa29.01■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 MS4A1P11836 297 aa29.01■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 DACT2Q5SW24 774 aa29.01■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 SAMD7Q7Z3H4 446 aa29.01■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 PSME4Q14997 1843 aa29■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 GTF2IP78347 998 aa29■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 VGLL2Q8N8G2 317 aa29■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 FBXO3Q9UK99 471 aa29■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 PANK1Q8TE04 598 aa28.99■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 MXD3Q9BW11 206 aa28.99■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 ZNF609O15014 1411 aa28.99■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 MYO3BQ8WXR4 1341 aa28.98■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 CIAO1O76071 339 aa28.98■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 USP17L8P0C7I0 530 aa28.98■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 IL1R1P14778 569 aa28.98■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 GYG1P46976 350 aa28.98■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 MTX1Q13505 466 aa28.98■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.98■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 GMLQ99445 158 aa28.98■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 HTRA3P83110 453 aa28.97■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 VPS37DQ86XT2 251 aa28.97■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 COPRSQ9NQ92 184 aa28.97■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 PASKQ96RG2 1323 aa28.96■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa28.96■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.96■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.96■■■□□ 2.23
PITX1-202ENST00000502676 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 EGFRP00533 1210 aa28.95■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 OGFOD1Q8N543 542 aa28.95■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 PGAP2Q9UHJ9 254 aa28.94■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 CEP350Q5VT06 3117 aa28.93■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 SLC5A1P13866 664 aa28.93■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.93■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 FGFR2P21802 821 aa28.92■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 LPIN2Q92539 896 aa28.92■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.92■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 JAG2Q9Y219 1238 aa28.92■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.91■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 SASH1O94885 1247 aa28.91■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 FBXO33Q7Z6M2 555 aa28.91■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 KIAA0825Q8IV33 1275 aa28.91■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 ATP2B3Q16720 1220 aa28.9■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 CREBZFQ9NS37 354 aa28.9■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 HDAC9Q9UKV0 1011 aa28.9■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.89■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
PITX1-202ENST00000502676 TMEM88BA6NKF7 163 aa28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms