RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		7.71	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	NFKBIE	O00221	500 aa		7.7	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	DGKG	P49619	791 aa		7.7	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	FGD1	P98174	961 aa		7.7	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	7.7	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		7.7	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	HHIP	Q96QV1	700 aa		7.7	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		7.7	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		7.7	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	GRIK5	Q16478	980 aa		7.69	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	PI16	Q6UXB8	463 aa		7.69	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	NXPE3	Q969Y0	559 aa		7.69	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	EHD4	Q9H223	541 aa		7.69	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		7.69	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		7.68	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	GIPC2	Q8TF65	315 aa		7.68	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		7.68	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		7.68	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	CCNJL	Q8IV13	435 aa		7.67	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	TCF12	Q99081	682 aa		7.67	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		7.67	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	NID1	P14543	1247 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	PTPRA	P18433	802 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	GRM2	Q14416	872 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	PODN	Q7Z5L7	613 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	SPG7	Q9UQ90	795 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	METTL12	A8MUP2	240 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	CDC27	P30260	824 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	GNA15	P30679	374 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	BAG6	P46379	1132 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	MSL1	Q68DK7	614 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	FRMD6	Q96NE9	622 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	BCO2	Q9BYV7	579 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	ADAM19	Q9H013	955 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	RNF19A	Q9NV58	838 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	PARP2	Q9UGN5	583 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PTPRK-215	ENST00000498284	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM177B	A6PVY3	158 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	PIK3R2	O00459	728 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	GNB5	O14775	395 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	GIPC1	O14908	333 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	BSND	Q8WZ55	320 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIM11	Q96F44	468 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	GRIA4	P48058	902 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	RASSF7	Q02833	373 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	ILDR2	Q71H61	639 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	PLVAP	Q9BX97	442 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	ABCB6	Q9NP58	842 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A096LPE4	126 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A1W2PPZ6	126 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	DAB2	P98082	770 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	PSMD2	Q13200	908 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	MUC3B	Q9H195	1237 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	SOX13	Q9UN79	622 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	PPME1	Q9Y570	386 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	EPHA1	P21709	976 aa		7.61	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	CDC25B	P30305	580 aa		7.61	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	FCGRT	P55899	365 aa		7.61	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	TMC4	Q7Z404	712 aa		7.61	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		7.61	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		7.61	□□□□□ -1.19
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM161B	Q96MY7	647 aa		7.61	□□□□□ -1.19

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