RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	KCNB2	Q92953	911 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	XDH	P47989	1333 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	ATP2B4	P23634	1241 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	HSPA4	P34932	840 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	SP8	Q8IXZ3	490 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	ST18	O60284	1047 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	DDR1	Q08345	913 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	MAP3K12	Q12852	859 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	KRT32	Q14532	448 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	STYK1	Q6J9G0	422 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	CERS3	Q8IU89	383 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	MASTL	Q96GX5	879 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	BCL11A	Q9H165	835 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	MSH5	O43196	834 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	PSMA5	P28066	241 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	KCNJ4	P48050	445 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	APPBP2	Q92624	585 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	CASZ1	Q86V15	1759 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	GOLIM4	O00461	696 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	MMP10	P09238	476 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	SRGN	P10124	158 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	ADORA1	P30542	326 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	NT5C2	P49902	561 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	11.28	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	VPS37D	Q86XT2	251 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	HSCB	Q8IWL3	235 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	CNKSR1	Q969H4	720 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565		H0YIN7	160 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	GNAT2	P19087	354 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	MCAM	P43121	646 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	NECTIN1	Q15223	517 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	KIF2C	Q99661	725 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	TAF5L	O75529	589 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	ADD2	P35612	726 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	ZAP70	P43403	619 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	PHKA1	P46020	1223 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	SMIM5	Q71RC9	77 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	MYH7	P12883	1935 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	ZMYM6	O95789	1325 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	ALX1	Q15699	326 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	EYA3	Q99504	573 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565		A0A0D9SFI3	127 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	BCAM	P50895	628 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LPIN3-204	ENST00000496565	RASGRF1	Q13972	1273 aa		11.24	□□□□□ -0.61

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