RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496281.1

RTEL1-TNFRSF6B-204, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,314 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.61■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NGLY1Q96IV0 654 aa20.61■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF75DP51815 510 aa20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DESP17661 470 aa20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SPECC1Q5M775 1068 aa20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IFNKQ9P0W0 207 aa20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BRD1O95696 1058 aa20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HSPA4P34932 840 aa20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KRT23Q9C075 422 aa20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KRT83P78385 493 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 A2MP01023 1474 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NF2P35240 595 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FLT4P35916 1363 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LIG1P18858 919 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CYP7A1P22680 504 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMTC2Q8N394 836 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VPS18Q9P253 973 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ESR2Q92731 530 aa20.58■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.58■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.58■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AFMP43652 599 aa20.58■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RTN1Q16799 776 aa20.58■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.58■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRIM47Q96LD4 638 aa20.58■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 A0A1B0GUL7 405 aa20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EYA1Q99502 592 aa20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IGSF3O75054 1194 aa20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ADGRL2O95490 1459 aa20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EVCP57679 992 aa20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KRT86O43790 486 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PRC1O43663 620 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MYL5Q02045 173 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 A6NNZ2 444 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TACC1O75410 805 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 A0A1W2PP64 1363 aa20.55■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NPATQ14207 1427 aa20.55■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AKR1B10O60218 316 aa20.55■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CETN1Q12798 172 aa20.55■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GTF3C6Q969F1 213 aa20.55■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.55■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CBX8Q9HC52 389 aa20.55■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.54■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CHST3Q7LGC8 479 aa20.54■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.54■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.54■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NBPF4Q96M43 638 aa20.54■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CNGA4Q8IV77 575 aa20.54■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GOPCQ9HD26 462 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WDR62O43379 1518 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SSH2Q76I76 1423 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MYO1BO43795 1136 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms