RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	TOMM70	O94826	608 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	PDE8B	O95263	885 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	POTEI	P0CG38	1075 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	POTEJ	P0CG39	1038 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	EPS15	P42566	896 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	SCNN1D	P51172	638 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	C1QTNF8	P60827	252 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	UBE4A	Q14139	1066 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	COA1	Q9GZY4	146 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	12.22	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	SCN4A	P35499	1836 aa		12.22	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	EPHX2	P34913	555 aa		12.21	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	GYG1	P46976	350 aa		12.21	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	ATP8B2	P98198	1209 aa		12.21	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	MTX1	Q13505	466 aa		12.21	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	PDE3A	Q14432	1141 aa		12.21	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		12.21	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	PODN	Q7Z5L7	613 aa		12.21	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	MXD3	Q9BW11	206 aa		12.21	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	COPRS	Q9NQ92	184 aa		12.21	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		12.21	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	JAG2	Q9Y219	1238 aa		12.21	□□□□□ -0.45
CALD1-223	ENST00000496024	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		12.2	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	USP17L3	A6NCW0	530 aa		12.2	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	USP17L4	A6NCW7	530 aa		12.2	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	CIAO1	O76071	339 aa		12.2	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	GTF2I	P78347	998 aa		12.2	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		12.2	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		12.2	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	CD209	Q9NNX6	404 aa		12.2	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		12.2	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	TFCP2	Q12800	502 aa		12.19	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	12.19	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	ATP2B3	Q16720	1220 aa		12.19	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		12.19	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	CEP85	Q6P2H3	762 aa		12.19	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	VPS37D	Q86XT2	251 aa		12.19	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	MICALL2	Q8IY33	904 aa		12.19	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	FBXO3	Q9UK99	471 aa		12.19	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	PSME4	Q14997	1843 aa		12.18	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024		H7C1D1	291 aa		12.18	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	SLC5A1	P13866	664 aa		12.18	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	BCAM	P50895	628 aa		12.18	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	DACT2	Q5SW24	774 aa		12.18	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	SSH3	Q8TE77	659 aa		12.18	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		12.18	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	IL1R1	P14778	569 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	FGFR2	P21802	821 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	POLA2	Q14181	598 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	CHADL	Q6NUI6	762 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	LPIN2	Q92539	896 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	DPF2	Q92785	391 aa		12.17	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	ADORA1	P30542	326 aa		12.16	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	TIMM10	P62072	90 aa		12.16	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		12.16	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	LDHD	Q86WU2	507 aa		12.16	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		12.16	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		12.16	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	BCL11A	Q9H165	835 aa		12.16	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024		F8W031	263 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	APBB1	O00213	710 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	SASH1	O94885	1247 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	EGFR	P00533	1210 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	USP17L8	P0C7I0	530 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	FSTL1	Q12841	308 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CALD1-223	ENST00000496024	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		12.15	□□□□□ -0.46

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