RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495556.1

TNS1-219, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-219ENST00000495556 MXD3Q9BW11 206 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 SPEF2Q9C093 1822 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 PSME4Q14997 1843 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 PI4KAP2A4QPH2 592 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 NEXNQ0ZGT2 675 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 TSPYL6Q8N831 410 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 GREM2Q9H772 168 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 MINPP1Q9UNW1 487 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 IGKV5-2P06315 115 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 FKBP1BP68106 108 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 KSR2Q6VAB6 950 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 OGFOD1Q8N543 542 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 TTLL11Q8NHH1 800 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 STK31Q9BXU1 1019 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 ZNF609O15014 1411 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 MED23Q9ULK4 1368 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 SASH1O94885 1247 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 TBC1D8O95759 1140 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 NF2P35240 595 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 PRKG1Q13976 671 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 MYH3P11055 1940 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 WNT10BO00744 389 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 DACT2Q5SW24 774 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 COA1Q9GZY4 146 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 NEURL1BA8MQ27 555 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 KCNJ4P48050 445 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 TTLL5Q6EMB2 1281 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 G2E3Q7L622 706 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 MPHOSPH8Q99549 860 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 MYO3BQ8WXR4 1341 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 SLC4A2P04920 1241 aa11.81□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 ITGA6P23229 1130 aa11.81□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 KLRK1P26718 216 aa11.81□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 GTF2IP78347 998 aa11.81□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 ARMC9Q7Z3E5 817 aa11.81□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.81□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 LEMD3Q9Y2U8 911 aa11.81□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 ZNF804BA4D1E1 1349 aa11.81□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa11.8□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 H7C1W4 665 aa11.8□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 ANKRD2Q9GZV1 360 aa11.8□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 FZD1Q9UP38 647 aa11.8□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 GPR25O00155 361 aa11.79□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 SREBF2Q12772 1141 aa11.79□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 GCKRQ14397 625 aa11.79□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 CHMP3Q9Y3E7 222 aa11.79□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 F8W031 263 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 SNAP23O00161 211 aa11.78□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 TM4SF4P48230 202 aa11.78□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 CHRNDQ07001 517 aa11.78□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 FLIIQ13045 1269 aa11.78□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 MYH16Q9H6N6 1097 aa11.78□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
TNS1-219ENST00000495556 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa11.77□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 FKTNO75072 461 aa11.77□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 TAF5LO75529 589 aa11.77□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 DLGAP5Q15398 846 aa11.77□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 CCDC184Q52MB2 194 aa11.77□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 WWC1Q8IX03 1113 aa11.77□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 DNAAF4Q8WXU2 420 aa11.77□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 SLC10A4Q96EP9 437 aa11.77□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 PLA2G12BQ9BX93 195 aa11.77□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 CD209Q9NNX6 404 aa11.77□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 CLRN2A0PK11 232 aa11.76□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 PLIN1O60240 522 aa11.76□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 CSF1RP07333 972 aa11.76□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 MMP14P50281 582 aa11.76□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 CASP7P55210 303 aa11.76□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 SPRYD7Q5W111 196 aa11.76□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.76□□□□□ -0.53
TNS1-219ENST00000495556 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms