RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494984.5

QARS-223, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 2

Gene QARS, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-223	ENST00000494984	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.7	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.7	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		11.7	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		11.69	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.69	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.69	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	TOMM70	O94826	608 aa		11.69	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	C1QTNF8	P60827	252 aa		11.69	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.69	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.69	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	PODN	Q7Z5L7	613 aa		11.69	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		11.69	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.69	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	SCN9A	Q15858	1988 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	POTEC	B2RU33	542 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	CIAO1	O76071	339 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	PDE8B	O95263	885 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	POTEI	P0CG38	1075 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	SLC5A1	P13866	664 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	EPS15	P42566	896 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	GYG1	P46976	350 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	MTX1	Q13505	466 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	PDE3A	Q14432	1141 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	MICALL2	Q8IY33	904 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.68	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	PSME4	Q14997	1843 aa		11.67	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	GTF2I	P78347	998 aa		11.67	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.67	□□□□□ -0.54	5e-7	■■□□□ 13.7
QARS-223	ENST00000494984	CEP85	Q6P2H3	762 aa		11.67	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.67	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		11.67	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.67	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.67	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.67	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.66	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984		H7C1D1	291 aa		11.66	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	TFCP2	Q12800	502 aa		11.66	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		11.66	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	LDHD	Q86WU2	507 aa		11.66	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.66	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	MXD3	Q9BW11	206 aa		11.66	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	BCL11A	Q9H165	835 aa		11.66	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.66	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		11.65	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.65	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	ATP8B2	P98198	1209 aa		11.65	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		11.65	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	CHADL	Q6NUI6	762 aa		11.65	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	LPIN2	Q92539	896 aa		11.65	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984	ZNF609	O15014	1411 aa		11.65	□□□□□ -0.54
QARS-223	ENST00000494984		F8W031	263 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	APBB1	O00213	710 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	HMMR	O75330	724 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	DACT2	Q5SW24	774 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	OGFOD1	Q8N543	542 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	DPF2	Q92785	391 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		11.64	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984		A0A1B0GUL7	405 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	IL1R1	P14778	569 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	BCAM	P50895	628 aa		11.63	□□□□□ -0.55
QARS-223	ENST00000494984	FSTL1	Q12841	308 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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