RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494546.1

CBX4-203, Transcript of chromobox 4, humanhuman

TSL 3

Gene CBX4, Length 432 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX4-203ENST00000494546 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
CBX4-203ENST00000494546 SNAP23O00161 211 aa41.82■■■■■ 4.29
CBX4-203ENST00000494546 AGBL3Q8NEM8 1001 aa41.82■■■■■ 4.29
CBX4-203ENST00000494546 FBXW7Q969H0 707 aa41.82■■■■■ 4.29
CBX4-203ENST00000494546 USP44Q9H0E7 712 aa41.82■■■■■ 4.29
CBX4-203ENST00000494546 RARSP54136 660 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
CBX4-203ENST00000494546 CNTNAP1P78357 1384 aa41.8■■■■■ 4.28
CBX4-203ENST00000494546 PLIN1O60240 522 aa41.79■■■■■ 4.28
CBX4-203ENST00000494546 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa41.79■■■■■ 4.28
CBX4-203ENST00000494546 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
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CBX4-203ENST00000494546 ANKRD44Q8N8A2 993 aa41.77■■■■■ 4.28
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CBX4-203ENST00000494546 ZNF609O15014 1411 aa41.77■■■■■ 4.28
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CBX4-203ENST00000494546 GMLQ99445 158 aa41.76■■■■■ 4.28
CBX4-203ENST00000494546 USP17L8P0C7I0 530 aa41.75■■■■■ 4.27
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CBX4-203ENST00000494546 CST9Q5W186 159 aa41.74■■■■■ 4.27
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CBX4-203ENST00000494546 STRIP1Q5VSL9 837 aa41.73■■■■■ 4.27
CBX4-203ENST00000494546 USP48Q86UV5 1035 aa41.73■■■■■ 4.27
CBX4-203ENST00000494546 CD209Q9NNX6 404 aa41.72■■■■■ 4.27
CBX4-203ENST00000494546 A0A1B0GUL6 1792 aa41.72■■■■■ 4.27
CBX4-203ENST00000494546 KIF16BQ96L93 1317 aa41.71■■■■■ 4.27
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CBX4-203ENST00000494546 VEGFBP49765 207 aa41.7■■■■■ 4.27
CBX4-203ENST00000494546 ZNF408Q9H9D4 720 aa41.7■■■■■ 4.27
CBX4-203ENST00000494546 GTF2IP78347 998 aa41.69■■■■■ 4.26
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CBX4-203ENST00000494546 MYO3BQ8WXR4 1341 aa41.69■■■■■ 4.26
CBX4-203ENST00000494546 TRPM7Q96QT4 1865 aa41.68■■■■■ 4.26
CBX4-203ENST00000494546 ZNF804AQ7Z570 1209 aa41.68■■■■■ 4.26
CBX4-203ENST00000494546 MYOZ2Q9NPC6 264 aa41.68■■■■■ 4.26
CBX4-203ENST00000494546 GGA3Q9NZ52 723 aa41.67■■■■■ 4.26
CBX4-203ENST00000494546 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa41.67■■■■■ 4.26
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CBX4-203ENST00000494546 LRRC24Q50LG9 513 aa41.64■■■■■ 4.26
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CBX4-203ENST00000494546 TLL2Q9Y6L7 1015 aa41.63■■■■■ 4.25
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CBX4-203ENST00000494546 IL1R1P14778 569 aa41.6■■■■■ 4.25
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CBX4-203ENST00000494546 TNNQ9UQP3 1299 aa41.52■■■■■ 4.24
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CBX4-203ENST00000494546 VGLL2Q8N8G2 317 aa41.51■■■■■ 4.24
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CBX4-203ENST00000494546 EYA2O00167 538 aa41.5■■■■■ 4.23
CBX4-203ENST00000494546 WNT10BO00744 389 aa41.5■■■■■ 4.23
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