RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493739.2

SPG20-AS1-203, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SPG20-AS1, Length 566 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG20-AS1-203ENST00000493739 PLIN1O60240 522 aa16.12■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 USP17L8P0C7I0 530 aa16.12■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.12■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.12■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 OGFOD1Q8N543 542 aa16.12■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 TRPM4Q8TD43 1214 aa16.12■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa16.12■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 UBE4AQ14139 1066 aa16.11■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa16.11■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 TTLL5Q6EMB2 1281 aa16.11■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 TXNRD3Q86VQ6 643 aa16.11■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.11■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 FBXW7Q969H0 707 aa16.11■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 MROH5Q6ZUA9 1318 aa16.11■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 ZNF609O15014 1411 aa16.11■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 SHTN1A0MZ66 631 aa16.1■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 DACT2Q5SW24 774 aa16.1■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 GMLQ99445 158 aa16.1■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 CD209Q9NNX6 404 aa16.1■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 DEFB115Q30KQ5 88 aa16.09■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.09■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.09■□□□□ 0.17
SPG20-AS1-203ENST00000493739 TRAF5O00463 557 aa16.08■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 GNAI3P08754 354 aa16.08■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 KLRK1P26718 216 aa16.08■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 GTF2IP78347 998 aa16.08■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 MYOZ2Q9NPC6 264 aa16.08■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16.08■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 CNTNAP1P78357 1384 aa16.08■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 SNAP23O00161 211 aa16.07■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 IL1R1P14778 569 aa16.07■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 METTL24Q5JXM2 366 aa16.07■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa16.07■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 KRT26Q7Z3Y9 468 aa16.07■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 SULF1Q8IWU6 871 aa16.07■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 IRS2Q9Y4H2 1338 aa16.06■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 RASSF10A6NK89 507 aa16.06■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 BCAR3O75815 825 aa16.06■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 PDE8BO95263 885 aa16.06■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 CELF2O95319 508 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 EGFRP00533 1210 aa16.06■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 SCARF1Q14162 830 aa16.06■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 CST9Q5W186 159 aa16.06■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.06■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 USP48Q86UV5 1035 aa16.06■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 FBXO3Q9UK99 471 aa16.06■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 SPEF2Q9C093 1822 aa16.05■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 SASH1O94885 1247 aa16.05■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 TRIM27P14373 513 aa16.05■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 ECE1P42892 770 aa16.05■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 LRRC24Q50LG9 513 aa16.05■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.05■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 VPS37DQ86XT2 251 aa16.05■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 EYA2O00167 538 aa16.04■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 MXD3Q9BW11 206 aa16.04■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 ZNF408Q9H9D4 720 aa16.04■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 GGA3Q9NZ52 723 aa16.04■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 TLL2Q9Y6L7 1015 aa16.04■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa16.03■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 VEGFBP49765 207 aa16.03■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 KIAA0825Q8IV33 1275 aa16.03■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 KLHDC4Q8TBB5 520 aa16.03■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 HHIPL1Q96JK4 782 aa16.03■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 MEIS3Q99687 375 aa16.03■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 SCN9AQ15858 1988 aa16.03■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 CIAO1O76071 339 aa16.02■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 GYG1P46976 350 aa16.02■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.02■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 C2orf69Q8N8R5 385 aa16.02■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 CLUAP1Q96AJ1 413 aa16.02■□□□□ 0.16
SPG20-AS1-203ENST00000493739 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.01■□□□□ 0.15
SPG20-AS1-203ENST00000493739 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SPG20-AS1-203ENST00000493739 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.01■□□□□ 0.15
SPG20-AS1-203ENST00000493739 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms