RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490730.1

SYNE4-205, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 1,175 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-205ENST00000490730 HUNKP57058 714 aa26.7■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 SULF1Q8IWU6 871 aa26.7■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 HHIPL1Q96JK4 782 aa26.7■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 USP17L8P0C7I0 530 aa26.69■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 MAP2K2P36507 400 aa26.69■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 ZNF609O15014 1411 aa26.68■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.68■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 KCNJ4P48050 445 aa26.67■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 SCARF1Q14162 830 aa26.67■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 C2orf69Q8N8R5 385 aa26.67■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.67■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 TSKSQ9UJT2 592 aa26.67■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.67■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.66■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.66■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 CSF1RP07333 972 aa26.66■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 GMLQ99445 158 aa26.66■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.66■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 BEND3Q5T5X7 828 aa26.65■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.65■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 MXD3Q9BW11 206 aa26.65■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 COA1Q9GZY4 146 aa26.65■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 KLRK1P26718 216 aa26.64■■□□□ 1.86
SYNE4-205ENST00000490730 CHRNDQ07001 517 aa26.63■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 DACT2Q5SW24 774 aa26.63■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.63■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 CDCA5Q96FF9 252 aa26.63■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 FOXO4P98177 505 aa26.62■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 NOGQ13253 232 aa26.62■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 RGMBQ6NW40 437 aa26.61■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 OGFOD1Q8N543 542 aa26.61■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 GRM8O00222 908 aa26.6■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.6■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
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SYNE4-205ENST00000490730 A0A1B0GUL6 1792 aa26.59■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 TAF5LO75529 589 aa26.59■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.59■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.59■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 ZIC5Q96T25 663 aa26.59■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 CA12O43570 354 aa26.58■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.58■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.58■■□□□ 1.85
SYNE4-205ENST00000490730 SNAP23O00161 211 aa26.57■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 GTF2IP78347 998 aa26.57■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.57■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.57■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.57■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.57■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 CCDC102AQ96A19 550 aa26.56■■□□□ 1.84
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SYNE4-205ENST00000490730 SASH1O94885 1247 aa26.55■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.55■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 ZNF521Q96K83 1311 aa26.55■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 PLIN1O60240 522 aa26.54■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 CD209Q9NNX6 404 aa26.54■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.54■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.54■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 WNT10BO00744 389 aa26.53■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa26.53■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.53■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa26.53■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 ABHD8Q96I13 439 aa26.52■■□□□ 1.84
SYNE4-205ENST00000490730 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa26.51■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.51■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 SLC10A3P09131 477 aa26.5■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 SUCLG2Q96I99 432 aa26.5■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.49■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 FKBP1BP68106 108 aa26.49■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 MOB2Q70IA6 237 aa26.49■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 E9PSI1 815 aa26.48■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 MMP14P50281 582 aa26.48■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 JAG2Q9Y219 1238 aa26.48■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 F8W031 263 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 NF2P35240 595 aa26.47■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 RASAL3Q86YV0 1011 aa26.47■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.47■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.46■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 CERS5Q8N5B7 392 aa26.46■■□□□ 1.83
SYNE4-205ENST00000490730 IL1R1P14778 569 aa26.45■■□□□ 1.82
SYNE4-205ENST00000490730 DLGAP5Q15398 846 aa26.45■■□□□ 1.82
SYNE4-205ENST00000490730 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
SYNE4-205ENST00000490730 TRPA1O75762 1119 aa26.44■■□□□ 1.82
SYNE4-205ENST00000490730 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.44■■□□□ 1.82
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