RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489356.1

FGD2-208, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene FGD2, Length 1,438 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD2-208ENST00000489356 PLIN1O60240 522 aa22.28■■□□□ 1.16
FGD2-208ENST00000489356 KLRK1P26718 216 aa22.28■■□□□ 1.16
FGD2-208ENST00000489356 DLK2Q6UY11 383 aa22.28■■□□□ 1.16
FGD2-208ENST00000489356 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.28■■□□□ 1.16
FGD2-208ENST00000489356 SUCLG2Q96I99 432 aa22.28■■□□□ 1.16
FGD2-208ENST00000489356 COA1Q9GZY4 146 aa22.28■■□□□ 1.16
FGD2-208ENST00000489356 SCN9AQ15858 1988 aa22.28■■□□□ 1.16
FGD2-208ENST00000489356 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
FGD2-208ENST00000489356 SNAP23O00161 211 aa22.27■■□□□ 1.16
FGD2-208ENST00000489356 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
FGD2-208ENST00000489356 IFFO2Q5TF58 517 aa22.27■■□□□ 1.16
FGD2-208ENST00000489356 MXD3Q9BW11 206 aa22.27■■□□□ 1.16
FGD2-208ENST00000489356 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.27■■□□□ 1.16
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FGD2-208ENST00000489356 USP17L8P0C7I0 530 aa22.26■■□□□ 1.15
FGD2-208ENST00000489356 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.26■■□□□ 1.15
FGD2-208ENST00000489356 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.26■■□□□ 1.15
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FGD2-208ENST00000489356 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.26■■□□□ 1.15
FGD2-208ENST00000489356 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.26■■□□□ 1.15
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FGD2-208ENST00000489356 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
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FGD2-208ENST00000489356 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
FGD2-208ENST00000489356 SCARF1Q14162 830 aa22.24■■□□□ 1.15
FGD2-208ENST00000489356 GGA3Q9NZ52 723 aa22.24■■□□□ 1.15
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FGD2-208ENST00000489356 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.23■■□□□ 1.15
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FGD2-208ENST00000489356 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.23■■□□□ 1.15
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FGD2-208ENST00000489356 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.23■■□□□ 1.15
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FGD2-208ENST00000489356 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.19■■□□□ 1.14
FGD2-208ENST00000489356 WBP1LQ9NX94 342 aa22.19■■□□□ 1.14
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FGD2-208ENST00000489356 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.19■■□□□ 1.14
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FGD2-208ENST00000489356 HUNKP57058 714 aa22.18■■□□□ 1.14
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FGD2-208ENST00000489356 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.18■■□□□ 1.14
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FGD2-208ENST00000489356 USP44Q9H0E7 712 aa22.17■■□□□ 1.14
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FGD2-208ENST00000489356 JAG2Q9Y219 1238 aa22.16■■□□□ 1.14
FGD2-208ENST00000489356 CDCA5Q96FF9 252 aa22.15■■□□□ 1.14
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FGD2-208ENST00000489356 SASH1O94885 1247 aa22.14■■□□□ 1.14
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FGD2-208ENST00000489356 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.11■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 CAPN15O75808 1086 aa22.11■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 RGMBQ6NW40 437 aa22.11■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 CERS5Q8N5B7 392 aa22.11■■□□□ 1.13
FGD2-208ENST00000489356 PCNTO95613 3336 aa22.11■■□□□ 1.13
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