RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488576.5

FAM107B-222, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-222	ENST00000488576	PIM2	Q9P1W9	311 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	COL26A1	Q96A83	441 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
FAM107B-222	ENST00000488576	SCNN1A	P37088	669 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	ASIC4	Q96FT7	647 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	RNF208	Q9H0X6	261 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	ATG3	Q9NT62	314 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM177B	A6PVY3	158 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	KIF4A	O95239	1232 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	PTPRA	P18433	802 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	FLII	Q13045	1269 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	MSMP	Q1L6U9	139 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	FDX2	Q6P4F2	183 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	CBLL1	Q75N03	491 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	PBX4	Q9BYU1	374 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576		A6NJR5	290 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	PRNP	P04156	253 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	F13B	P05160	661 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	FOSL1	P15407	271 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	NLRP12	P59046	1061 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM26D	Q5JW98	314 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	FBXL6	Q8N531	539 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	FBXL18	Q96ME1	805 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	ADAM19	Q9H013	955 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576		H3BRJ5	948 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	ITGB5	P18084	799 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	RXRB	P28702	533 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	SGO2	Q562F6	1265 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	WNT8B	Q93098	351 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	ZMYND15	Q9H091	742 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	CABP4	P57796	275 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	COL19A1	Q14993	1142 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	CEP120	Q8N960	986 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	C16orf46	Q6P387	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	SHISA5	Q8N114	240 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM107B-222	ENST00000488576	MEGF11	A6BM72	1044 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	TNFRSF10B	O14763	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	ZAP70	P43403	619 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	CYP26A1	O43174	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	PRMT3	O60678	531 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	ARL4D	P49703	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	NFKBIB	Q15653	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	PAOX	Q6QHF9	649 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	FLCN	Q8NFG4	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	GPR152	Q8TDT2	470 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	ACPP	P15309	386 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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