RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486260.5

THBS3-207, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 5

Gene THBS3, Length 1,763 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-207ENST00000486260 POLLQ9UGP5 575 aa20.28■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 LTBP1Q14766 1721 aa20.27■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.27■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.27■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
THBS3-207ENST00000486260 C6orf229H3BNL8 230 aa20.26■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 MX1P20591 662 aa20.26■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 KLRK1P26718 216 aa20.26■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 PDE1AP54750 535 aa20.26■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 CCDC93Q567U6 631 aa20.26■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 GORABQ5T7V8 394 aa20.26■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 SNED1Q8TER0 1413 aa20.25■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.25■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.24■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.24■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.24■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 STAP2Q9UGK3 403 aa20.24■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.24■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 GYG1P46976 350 aa20.23■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 SOGA3Q5TF21 947 aa20.23■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.23■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 GPATCH3Q96I76 525 aa20.23■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 PHKA1P46020 1223 aa20.23■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 BCAMP50895 628 aa20.23■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.23■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.22■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.22■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 CCDC102BQ68D86 513 aa20.22■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.22■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 RIMBP2O15034 1052 aa20.21■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.21■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.21■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.21■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.21■□□□□ 0.83
THBS3-207ENST00000486260 MED23Q9ULK4 1368 aa20.2■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 WASHC4Q2M389 1173 aa20.2■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 VPS37DQ86XT2 251 aa20.2■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 EYA3Q99504 573 aa20.2■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.2■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 ATP5JP18859 108 aa20.19■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.19■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 PSMD1Q99460 953 aa20.19■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.19■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 AOX1Q06278 1338 aa20.19■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 ERC2O15083 957 aa20.18■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 SCARF1Q14162 830 aa20.18■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 TTC22Q5TAA0 569 aa20.18■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 NFKBIEO00221 500 aa20.17■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.17■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.17■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.17■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 MCAMP43121 646 aa20.16■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 AOC3Q16853 763 aa20.16■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.16■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.16■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 DOK7Q18PE1 504 aa20.16■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 PI16Q6UXB8 463 aa20.16■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 CD209Q9NNX6 404 aa20.16■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 SNRKQ9NRH2 765 aa20.16■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 PPIP5K2O43314 1243 aa20.15■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.15■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 RASGRF1Q13972 1273 aa20.15■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 HAUS7Q99871 368 aa20.15■□□□□ 0.82
THBS3-207ENST00000486260 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.14■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.14■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 G3V3G9 751 aa20.13■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 RASSF7Q02833 373 aa20.13■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.13■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 COA1Q9GZY4 146 aa20.13■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 UTRNP46939 3433 aa20.13■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.13■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 IL1R1P14778 569 aa20.13■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 ZAP70P43403 619 aa20.13■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 SPATA5Q8NB90 893 aa20.13■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.13■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.12■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.12■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.12■□□□□ 0.81
THBS3-207ENST00000486260 VPS33BQ9H267 617 aa20.12■□□□□ 0.81
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