RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.62■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 FAM161AQ3B820 660 aa25.62■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 GGA3Q9NZ52 723 aa25.62■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 ADM5C9JUS6 153 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 COA1Q9GZY4 146 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 OGFOD1Q8N543 542 aa25.6■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 ZNF609O15014 1411 aa25.6■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.6■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 CA12O43570 354 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 CSF1RP07333 972 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 CASP7P55210 303 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 SCARF1Q14162 830 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 F6X3S4 739 aa25.58■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 NOGQ13253 232 aa25.58■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 DLK2Q6UY11 383 aa25.58■■□□□ 1.69
ACTB-212ENST00000484841 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 RGMBQ6NW40 437 aa25.57■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.56■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 BEND3Q5T5X7 828 aa25.56■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.56■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.56■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 CHRNDQ07001 517 aa25.55■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 CCDC102AQ96A19 550 aa25.55■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 CDCA5Q96FF9 252 aa25.55■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 GMLQ99445 158 aa25.55■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 DACT2Q5SW24 774 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 GRM8O00222 908 aa25.53■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 MMP14P50281 582 aa25.53■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 TSKSQ9UJT2 592 aa25.53■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.53■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 ALDH1L1O75891 902 aa25.52■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.52■■□□□ 1.68
ACTB-212ENST00000484841 FOXO4P98177 505 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 MXD3Q9BW11 206 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 GTF2IP78347 998 aa25.5■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 TAF5LO75529 589 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 KLRK1P26718 216 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 NF2P35240 595 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 FKBP1BP68106 108 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 CD209Q9NNX6 404 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.47■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.47■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.47■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 PLIN1O60240 522 aa25.46■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 A0A1B0GUL6 1792 aa25.46■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.45■■□□□ 1.67
ACTB-212ENST00000484841 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 WNT10BO00744 389 aa25.45■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 ABHD8Q96I13 439 aa25.45■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.45■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 SASH1O94885 1247 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 ZIC5Q96T25 663 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 E9PSI1 815 aa25.43■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 SLC10A3P09131 477 aa25.43■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.43■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 ZNF521Q96K83 1311 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 SNAP23O00161 211 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 DLGAP5Q15398 846 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 PTPRCP08575 1304 aa25.4■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.4■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 MYO1BO43795 1136 aa25.39■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 IL1R1P14778 569 aa25.39■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 SUCLG2Q96I99 432 aa25.39■■□□□ 1.66
ACTB-212ENST00000484841 F8W031 263 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 TRPA1O75762 1119 aa25.37■■□□□ 1.65
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