RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483670.5

PDCD4-208, Transcript of programmed cell death 4, human

TSL 5

Gene PDCD4, Length 774 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDCD4-208	ENST00000483670	LDHD	Q86WU2	507 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	ZNF609	O15014	1411 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	CIAO1	O76071	339 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	LRRC24	Q50LG9	513 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	USP17L3	A6NCW0	530 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	USP17L4	A6NCW7	530 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	PDE8B	O95263	885 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	COPRS	Q9NQ92	184 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	SRGAP3	O43295	1099 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	EPS15	P42566	896 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	CHADL	Q6NUI6	762 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670		H7C1D1	291 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	KLRK1	P26718	216 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	PANK1	Q8TE04	598 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
PDCD4-208	ENST00000483670	SNAP23	O00161	211 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	CD209	Q9NNX6	404 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	PDE3A	Q14432	1141 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	IL1R1	P14778	569 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	HSPA6	P17066	643 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	MICALL2	Q8IY33	904 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	SIL1	Q9H173	461 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	MMP14	P50281	582 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	POTEI	P0CG38	1075 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	POTEJ	P0CG39	1038 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PDCD4-208	ENST00000483670	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	DACT2	Q5SW24	774 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	VPS37D	Q86XT2	251 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	LPIN2	Q92539	896 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	FBXW7	Q969H0	707 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	SLC5A1	P13866	664 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	FGFR2	P21802	821 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	ATP8B2	P98198	1209 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	GML	Q99445	158 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	SASH1	O94885	1247 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	USP17L8	P0C7I0	530 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	GTF2I	P78347	998 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	GYG1	P46976	350 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	APLP1	P51693	650 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	SSH3	Q8TE77	659 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	COG6	Q9Y2V7	657 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	POLA2	Q14181	598 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	OGFOD1	Q8N543	542 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PDCD4-208	ENST00000483670	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	32.01	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	ATP2B3	Q16720	1220 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	CNTROB	Q8N137	903 aa		32	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		32	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		32	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	SHTN1	A0MZ66	631 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	CEP85	Q6P2H3	762 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PDCD4-208	ENST00000483670	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71

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