RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.99■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 ZNF609O15014 1411 aa25.99■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 LRRC24Q50LG9 513 aa25.98■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.98■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.98■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.98■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 METTL24Q5JXM2 366 aa25.98■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 DPF2Q92785 391 aa25.98■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.97■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 MICALL2Q8IY33 904 aa25.97■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.96■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 USP17L3A6NCW0 530 aa25.96■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 USP17L4A6NCW7 530 aa25.96■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 GNAI2P04899 355 aa25.96■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 RLBP1P12271 317 aa25.96■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.96■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 H7C1D1 291 aa25.95■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 UBE4AQ14139 1066 aa25.95■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.95■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 FBXW7Q969H0 707 aa25.95■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 SHTN1A0MZ66 631 aa25.94■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 EYA2O00167 538 aa25.94■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 APLP1P51693 650 aa25.93■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 SIL1Q9H173 461 aa25.93■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 CD209Q9NNX6 404 aa25.93■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.93■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 PDE8BO95263 885 aa25.93■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 MS4A1P11836 297 aa25.93■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 MTX1Q13505 466 aa25.93■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.93■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.93■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 FBXO3Q9UK99 471 aa25.93■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 SRGAP3O43295 1099 aa25.92■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.92■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 DACT2Q5SW24 774 aa25.91■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.91■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 PANK1Q8TE04 598 aa25.91■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.91■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 CIAO1O76071 339 aa25.9■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 GTF2IP78347 998 aa25.89■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.89■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.89■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 COPRSQ9NQ92 184 aa25.89■■□□□ 1.74
NELFE-208ENST00000481121 IL1R1P14778 569 aa25.88■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.88■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 CNTROBQ8N137 903 aa25.88■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 GYG1P46976 350 aa25.88■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 GMLQ99445 158 aa25.88■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 MXD3Q9BW11 206 aa25.88■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 PASKQ96RG2 1323 aa25.87■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 USP17L8P0C7I0 530 aa25.87■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.86■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.86■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 VPS37DQ86XT2 251 aa25.86■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.86■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 EGFRP00533 1210 aa25.85■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.85■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.84■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.84■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 SLC5A1P13866 664 aa25.83■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 FGFR2P21802 821 aa25.83■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 HTRA3P83110 453 aa25.83■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 OGFOD1Q8N543 542 aa25.83■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 LPIN2Q92539 896 aa25.83■■□□□ 1.73
NELFE-208ENST00000481121 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.83■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.83■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 ATP2B3Q16720 1220 aa25.82■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 JAG2Q9Y219 1238 aa25.82■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 SASH1O94885 1247 aa25.81■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.81■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.81■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.81■■□□□ 1.72
NELFE-208ENST00000481121 COG6Q9Y2V7 657 aa25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms