RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475176.1

NOM1-205, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 3

Gene NOM1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-205ENST00000475176 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
NOM1-205ENST00000475176 USP17L3A6NCW0 530 aa22.39■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 USP17L4A6NCW7 530 aa22.39■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 UBE4AQ14139 1066 aa22.39■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 CHADLQ6NUI6 762 aa22.39■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.39■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.39■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 DPF2Q92785 391 aa22.39■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 FBXW7Q969H0 707 aa22.39■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
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NOM1-205ENST00000475176 H7C1D1 291 aa22.38■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 EYA2O00167 538 aa22.38■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 SRGAP3O43295 1099 aa22.38■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
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NOM1-205ENST00000475176 POTEJP0CG39 1038 aa22.38■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
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NOM1-205ENST00000475176 SIL1Q9H173 461 aa22.38■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 HSPA6P17066 643 aa22.37■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 FBXO3Q9UK99 471 aa22.37■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 PDE8BO95263 885 aa22.36■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 MICALL2Q8IY33 904 aa22.36■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 CIAO1O76071 339 aa22.35■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 MTX1Q13505 466 aa22.35■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.35■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 CD209Q9NNX6 404 aa22.35■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.34■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 PSME4Q14997 1843 aa22.34■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.34■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.34■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 VPS37DQ86XT2 251 aa22.34■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 COPRSQ9NQ92 184 aa22.34■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.33■■□□□ 1.17
NOM1-205ENST00000475176 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.33■■□□□ 1.17
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NOM1-205ENST00000475176 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.32■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.32■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.31■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 SHTN1A0MZ66 631 aa22.31■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 IL1R1P14778 569 aa22.31■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 GYG1P46976 350 aa22.31■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 APLP1P51693 650 aa22.31■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 DACT2Q5SW24 774 aa22.31■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.31■■□□□ 1.16
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NOM1-205ENST00000475176 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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NOM1-205ENST00000475176 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.3■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.3■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 ZNF609O15014 1411 aa22.3■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.29■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 CNTROBQ8N137 903 aa22.29■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 OGFOD1Q8N543 542 aa22.29■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 LPIN2Q92539 896 aa22.29■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 MXD3Q9BW11 206 aa22.29■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 COG6Q9Y2V7 657 aa22.29■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 ATP8B2P98198 1209 aa22.28■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 PDE3AQ14432 1141 aa22.28■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 ATP2B3Q16720 1220 aa22.28■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 GMLQ99445 158 aa22.28■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 SASH1O94885 1247 aa22.27■■□□□ 1.16
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NOM1-205ENST00000475176 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.27■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NOM1-205ENST00000475176 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NOM1-205ENST00000475176 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.26■■□□□ 1.15
NOM1-205ENST00000475176 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.26■■□□□ 1.15
NOM1-205ENST00000475176 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NOM1-205ENST00000475176 MMP14P50281 582 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-205ENST00000475176 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-205ENST00000475176 JAG2Q9Y219 1238 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-205ENST00000475176 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-205ENST00000475176 BCAMP50895 628 aa22.24■■□□□ 1.15
NOM1-205ENST00000475176 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NOM1-205ENST00000475176 POLA2Q14181 598 aa22.24■■□□□ 1.15
NOM1-205ENST00000475176 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.24■■□□□ 1.15
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