RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 C20orf194Q5TEA3 1177 aa13.53□□□□□ -0.24
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SH3BP1-207ENST00000471650 NUTM1Q86Y26 1132 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 MICALL2Q8IY33 904 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 NYXQ9GZU5 481 aa13.53□□□□□ -0.24
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SH3BP1-207ENST00000471650 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
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SH3BP1-207ENST00000471650 CAP1Q01518 475 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-207ENST00000471650 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
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SH3BP1-207ENST00000471650 OTOP1Q7RTM1 612 aa13.48□□□□□ -0.25
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SH3BP1-207ENST00000471650 DDX19BQ9UMR2 479 aa13.48□□□□□ -0.25
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SH3BP1-207ENST00000471650 LAMB2P55268 1798 aa13.46□□□□□ -0.25
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SH3BP1-207ENST00000471650 CRAMP1Q96RY5 1269 aa13.44□□□□□ -0.26
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SH3BP1-207ENST00000471650 LRRC37AA6NMS7 1700 aa13.43□□□□□ -0.26
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SH3BP1-207ENST00000471650 TNIP1Q15025 636 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
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SH3BP1-207ENST00000471650 KCNQ5Q9NR82 932 aa13.43□□□□□ -0.26
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