RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469140.2

MTA1-209, Transcript of metastasis associated 1, human

TSL 5

Gene MTA1, Length 1,666 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTA1-209	ENST00000469140	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	AK9	Q5TCS8	1911 aa		28.6	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	FSD1	Q9BTV5	496 aa		28.6	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		28.6	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	BCAM	P50895	628 aa		28.59	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	CNKSR1	Q969H4	720 aa		28.59	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		28.59	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	GOLIM4	O00461	696 aa		28.58	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	ATP2B4	P23634	1241 aa		28.58	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	MCAM	P43121	646 aa		28.58	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	GPSM2	P81274	684 aa		28.58	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	28.58	■■■□□ 2.17	1e-10	■■■□□ 14.9
MTA1-209	ENST00000469140	SCARF1	Q14162	830 aa		28.58	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		28.58	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		28.58	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	ILDR2	Q71H61	639 aa		28.58	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		28.58	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	CHRNA5	P30532	468 aa		28.57	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		28.57	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		28.56	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		28.56	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	VPS37D	Q86XT2	251 aa		28.56	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		28.56	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	SNRK	Q9NRH2	765 aa		28.56	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	GGA1	Q9UJY5	639 aa		28.56	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	ZAP70	P43403	619 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	GYG1	P46976	350 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	REC8	O95072	547 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	SPATA5	Q8NB90	893 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	ZBTB22	O15209	634 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	RASGRF1	Q13972	1273 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	SLC51A	Q86UW1	340 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	UFL1	O94874	794 aa		28.53	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	SEMA3E	O15041	775 aa		28.52	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	KLRK1	P26718	216 aa		28.52	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	PI16	Q6UXB8	463 aa		28.52	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		28.52	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		28.52	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		28.52	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	TGFB2	P61812	414 aa		28.51	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		28.51	■■■□□ 2.16
MTA1-209	ENST00000469140	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		28.51	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	SGSM2	O43147	1006 aa		28.51	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	MPND	Q8N594	471 aa		28.51	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		28.5	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		28.49	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		28.49	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	POLL	Q9UGP5	575 aa		28.49	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	RAD50	Q92878	1312 aa		28.49	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	LTBP1	Q14766	1721 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	C6orf229	H3BNL8	230 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	TTLL6	Q8N841	843 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	DPEP1	P16444	411 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	28.47	■■■□□ 2.15	3e-7	■■■□□ 16.5
MTA1-209	ENST00000469140	MED23	Q9ULK4	1368 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	KCNA3	P22001	575 aa		28.46	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	PTGER2	P43116	358 aa		28.46	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		28.46	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	FAM227B	Q96M60	508 aa		28.46	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	USP26	Q9BXU7	913 aa		28.46	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140		A0A0G2JLW4	131 aa		28.45	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.15
MTA1-209	ENST00000469140	OLFM4	Q6UX06	510 aa		28.45	■■■□□ 2.14
MTA1-209	ENST00000469140	IL25	Q9H293	177 aa		28.45	■■■□□ 2.14
MTA1-209	ENST00000469140	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
MTA1-209	ENST00000469140	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		28.45	■■■□□ 2.14
MTA1-209	ENST00000469140	SLX4	Q8IY92	1834 aa		28.45	■■■□□ 2.14
MTA1-209	ENST00000469140		A0A0D9SFI3	127 aa		28.44	■■■□□ 2.14
MTA1-209	ENST00000469140	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
MTA1-209	ENST00000469140	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		28.44	■■■□□ 2.14
MTA1-209	ENST00000469140	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		28.44	■■■□□ 2.14

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