RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 USP17L3A6NCW0 530 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1-205ENST00000466097 USP17L4A6NCW7 530 aa18.44■□□□□ 0.54
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SH3BP1-205ENST00000466097 USP17L1Q7RTZ2 530 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1-205ENST00000466097 MICALL2Q8IY33 904 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1-205ENST00000466097 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
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SH3BP1-205ENST00000466097 TXNRD3Q86VQ6 643 aa18.43■□□□□ 0.54
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SH3BP1-205ENST00000466097 HDAC9Q9UKV0 1011 aa18.34■□□□□ 0.53
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SH3BP1-205ENST00000466097 PCNTO95613 3336 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-205ENST00000466097 SASH1O94885 1247 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-205ENST00000466097 EGFRP00533 1210 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-205ENST00000466097 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-205ENST00000466097 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-205ENST00000466097 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-205ENST00000466097 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-205ENST00000466097 PANK1Q8TE04 598 aa18.32■□□□□ 0.52
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