RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	22.12	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	CHADL	Q6NUI6	762 aa		22.12	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	FBXW7	Q969H0	707 aa		22.12	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	POTEI	P0CG38	1075 aa		22.11	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	POTEJ	P0CG39	1038 aa		22.11	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	EPHX2	P34913	555 aa		22.11	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		22.11	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	EYA2	O00167	538 aa		22.1	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	22.1	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	EPS15	P42566	896 aa		22.1	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	SCNN1D	P51172	638 aa		22.1	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	PODN	Q7Z5L7	613 aa		22.1	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	KLRG1	Q96E93	195 aa		22.1	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	COA1	Q9GZY4	146 aa		22.1	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	22.1	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	COG6	Q9Y2V7	657 aa		22.1	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	22.1	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	PSME4	Q14997	1843 aa		22.09	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	UBE4A	Q14139	1066 aa		22.09	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	LDHD	Q86WU2	507 aa		22.09	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		22.09	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		22.08	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		22.08	■■□□□ 1.13
USP19-210	ENST00000465902	USP17L3	A6NCW0	530 aa		22.07	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	USP17L4	A6NCW7	530 aa		22.07	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	PDE8B	O95263	885 aa		22.07	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	MTX1	Q13505	466 aa		22.07	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	22.07	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		22.07	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	22.07	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902		H7C1D1	291 aa		22.06	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	22.06	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		22.06	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	CD209	Q9NNX6	404 aa		22.06	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	COPRS	Q9NQ92	184 aa		22.06	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	22.06	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	FBXO3	Q9UK99	471 aa		22.06	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		22.06	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		22.05	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	CIAO1	O76071	339 aa		22.05	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	22.05	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	VPS37D	Q86XT2	251 aa		22.05	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	JMY	Q8N9B5	988 aa		22.05	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		22.05	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	22.04	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	22.04	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	GYG1	P46976	350 aa		22.04	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	GTF2I	P78347	998 aa		22.04	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	PDE3A	Q14432	1141 aa		22.04	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	22.04	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		22.04	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		22.04	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	22.04	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	MICALL2	Q8IY33	904 aa		22.04	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		22.04	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	22.04	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		22.04	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	SHTN1	A0MZ66	631 aa		22.03	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	22.03	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	22.03	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	ATP8B2	P98198	1209 aa		22.03	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		22.03	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	DPF2	Q92785	391 aa		22.03	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	22.02	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	22.02	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		22.02	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	22.02	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	MXD3	Q9BW11	206 aa		22.02	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	22.02	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	PASK	Q96RG2	1323 aa		22.02	■■□□□ 1.12
USP19-210	ENST00000465902	SLC5A1	P13866	664 aa		22.01	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	22.01	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		22.01	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	22.01	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	CREBZF	Q9NS37	354 aa		22.01	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	22	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	22	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	ATP2B3	Q16720	1220 aa		22	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	DACT2	Q5SW24	774 aa		22	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	LPIN2	Q92539	896 aa		22	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	JAG2	Q9Y219	1238 aa		22	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	IL1R1	P14778	569 aa		21.99	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	21.99	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		21.99	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	21.99	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		21.98	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	21.98	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	USP17L8	P0C7I0	530 aa		21.98	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	FGFR2	P21802	821 aa		21.98	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	BCAM	P50895	628 aa		21.98	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	21.98	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	TFCP2	Q12800	502 aa		21.98	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	POLA2	Q14181	598 aa		21.98	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	21.98	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	CEP85	Q6P2H3	762 aa		21.98	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	CNTROB	Q8N137	903 aa		21.98	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		21.98	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	SSH3	Q8TE77	659 aa		21.98	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		21.98	■■□□□ 1.11
USP19-210	ENST00000465902	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	21.97	■■□□□ 1.11

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