RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 POLLQ9UGP5 575 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 SPEF2Q9C093 1822 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC41PQ6P2S7 1318 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 SNAP23O00161 211 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 PDE4AP27815 886 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 PDE1AP54750 535 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 VPS33BQ9H267 617 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 OSBPL3Q9H4L5 887 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 AOX1Q06278 1338 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC37AA6NMS7 1700 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 ADORA1P30542 326 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 RGS3P49796 1198 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 WASHC4Q2M389 1173 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC39AQ5SRH9 613 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC102BQ68D86 513 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF804AQ7Z570 1209 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXO33Q7Z6M2 555 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC51AQ86UW1 340 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 SALL3Q9BXA9 1300 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 MED23Q9ULK4 1368 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 G3V3G9 751 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBTB22O15209 634 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP5JP18859 108 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 BCAMP50895 628 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 COA1Q9GZY4 146 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 TAOK3Q9H2K8 898 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 SNED1Q8TER0 1413 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 IRS2Q9Y4H2 1338 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 SEMA3EO15041 775 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 KLRK1P26718 216 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 PHKA1P46020 1223 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 GYG1P46976 350 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 CACNA1SQ13698 1873 aa11.46□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 RIMBP2O15034 1052 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 PPIP5K2O43314 1243 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA2012Q0VF49 1180 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 PI4K2BQ8TCG2 481 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 BOLA2Q9H3K6 86 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 CD209Q9NNX6 404 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 DENND2AQ9ULE3 1009 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1B0GUL6 1792 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 LTBP1Q14766 1721 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 GRIN3BO60391 1043 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 IL1R1P14778 569 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 IARSP41252 1262 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR162Q16538 588 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 AOC3Q16853 763 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC22Q5TAA0 569 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 TSHZ3Q63HK5 1081 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 PODNQ7Z5L7 613 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 SKAP1Q86WV1 359 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 LARGE2Q8N3Y3 721 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 HAUS7Q99871 368 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
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SH3BP4-208ENST00000462602 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 BMP2KLQ5H9B9 411 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA5Q8NB90 893 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 JDP2Q8WYK2 163 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.42□□□□□ -0.58
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SH3BP4-208ENST00000462602 RASGRF1Q13972 1273 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 DOK7Q18PE1 504 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 NIM1KQ8IY84 436 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 CNTROBQ8N137 903 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR66Q8TBY9 1149 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 EVI5LQ96CN4 794 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 HMG20BQ9P0W2 317 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 ARAP2Q8WZ64 1704 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-208ENST00000462602 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.41□□□□□ -0.58
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