RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461648.2

TSC2-208, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 2

Gene TSC2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-208	ENST00000461648	LPIN2	Q92539	896 aa		31.5	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		31.5	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648		G3V3G9	751 aa		31.49	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	SLC5A1	P13866	664 aa		31.49	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	DOK7	Q18PE1	504 aa		31.49	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		31.49	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	DCTPP1	Q9H773	170 aa		31.49	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	RAB11FIP3	O75154	756 aa		31.48	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		31.48	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		31.48	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	ECE2	O60344	883 aa		31.47	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		31.47	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	APBB1	O00213	710 aa		31.46	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		31.46	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	COA1	Q9GZY4	146 aa		31.46	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	GPR108	Q9NPR9	543 aa		31.46	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF609	O15014	1411 aa		31.46	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	FZD9	O00144	591 aa		31.45	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		31.45	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		31.45	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
TSC2-208	ENST00000461648		A0A1B0GUL7	405 aa		31.44	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	GYG1	P46976	350 aa		31.44	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	TIMM10	P62072	90 aa		31.44	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	TNNI3K	Q59H18	835 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	YDJC	A8MPS7	323 aa		31.42	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	PODN	Q7Z5L7	613 aa		31.42	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		31.42	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	CD209	Q9NNX6	404 aa		31.42	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		31.41	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		31.41	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	SCN9A	Q15858	1988 aa		31.41	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	ADORA1	P30542	326 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	VPS37D	Q86XT2	251 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	XAGE2	Q96GT9	111 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	IGHD	P01880	384 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	BCAM	P50895	628 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	GCC1	Q96CN9	775 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	PSME4	Q14997	1843 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TSC2-208	ENST00000461648	IL1R1	P14778	569 aa		31.38	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	CXCL9	Q07325	125 aa		31.38	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	RAD17	O75943	681 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		31.36	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		31.36	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	AACS	Q86V21	672 aa		31.36	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		31.35	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		31.34	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	GLTPD2	A6NH11	291 aa		31.34	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	31.34	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	PHKA1	P46020	1223 aa		31.34	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	TNIP1	Q15025	636 aa		31.34	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	GORAB	Q5T7V8	394 aa		31.34	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	YY1	P25490	414 aa		31.33	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	CCDC102B	Q68D86	513 aa		31.33	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	BCL11A	Q9H165	835 aa		31.33	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		31.33	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
TSC2-208	ENST00000461648	USP17L3	A6NCW0	530 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	USP17L4	A6NCW7	530 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	PSMD14	O00487	310 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	SMC5	Q8IY18	1101 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	GPC2	Q8N158	579 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	FBXW7	Q969H0	707 aa		31.31	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	31.3	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	GTF2I	P78347	998 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		31.29	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		31.28	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		31.28	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		31.28	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	SEMA3E	O15041	775 aa		31.27	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	ZBTB22	O15209	634 aa		31.27	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	DACT2	Q5SW24	774 aa		31.27	■■■□□ 2.6
TSC2-208	ENST00000461648	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		31.27	■■■□□ 2.6

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