RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461134.1

TTPAL-205, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 2

Gene TTPAL, Length 3,455 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-205ENST00000461134 ATP2B1P20020 1258 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 GORABQ5T7V8 394 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 NEUROD6Q96NK8 337 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 MTFR1LQ9H019 292 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 SNAP23O00161 211 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 C21orf2O43822 256 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 ST18O60284 1047 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 KDM4AO75164 1064 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 NFIXQ14938 502 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 SLC51AQ86UW1 340 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 MNAT1P51948 309 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 RABEP1Q15276 862 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 SRLQ86TD4 932 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 VAMP4O75379 141 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 RPS6KA4O75676 772 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 SSR1P43307 286 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 LRMPQ12912 555 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 CCDC186Q7Z3E2 898 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 ZNF408Q9H9D4 720 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 KIF1AQ12756 1690 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 PLSCR1O15162 318 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 CAPN15O75808 1086 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 ST5P78524 1137 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 MUM1L1Q5H9M0 696 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 SMARCE1Q969G3 411 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 MPHOSPH8Q99549 860 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 DISP2A7MBM2 1401 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 DPEP1P16444 411 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 VPS37DQ86XT2 251 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 DNAAF4Q8WXU2 420 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 SGSM3Q96HU1 749 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 ANKRD65E5RJM6 399 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 H0YHG0 523 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 WDR63Q8IWG1 891 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 NLGN1Q8N2Q7 840 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 NLRP3Q96P20 1036 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 F8W031 263 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 ERFEQ4G0M1 354 aa9.4□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 PACS2Q86VP3 889 aa9.4□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 RGPD5Q99666 1765 aa9.4□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 GLI3P10071 1580 aa9.4□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.4□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 ANKRD45Q5TZF3 282 aa9.4□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 MCTP2Q6DN12 878 aa9.4□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.4□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TTPAL-205ENST00000461134 ADGRB2O60241 1585 aa9.4□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 PTPN14Q15678 1187 aa9.4□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 KIF1BPQ96EK5 621 aa9.4□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 ERO1AQ96HE7 468 aa9.4□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 KIF2CQ99661 725 aa9.4□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 HYPKQ9NX55 129 aa9.4□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 H0YIN7 160 aa9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 TAF5LO75529 589 aa9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 SUSD4Q5VX71 490 aa9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 LMBR1LQ6UX01 489 aa9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 TMEM57Q8N5G2 664 aa9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 TRIM5Q9C035 493 aa9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.39□□□□□ -0.91
TTPAL-205ENST00000461134 RNF181Q9P0P0 153 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms