RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460130.5

TCL6-204, Transcript of T cell leukemia/lymphoma 6, human

TSL 3 BASIC

Gene TCL6, Length 911 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCL6-204	ENST00000460130	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	SGSM2	O43147	1006 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	ATP2B3	Q16720	1220 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	TTLL6	Q8N841	843 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	SNRK	Q9NRH2	765 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	PIM2	Q9P1W9	311 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	CHRND	Q07001	517 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	SLC51A	Q86UW1	340 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	DOCK2	Q92608	1830 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	SNAP23	O00161	211 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	TAF5L	O75529	589 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	SCARF1	Q14162	830 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	CASC1	Q6TDU7	716 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	TMC4	Q7Z404	712 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	SP8	Q8IXZ3	490 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	IL17RA	Q96F46	866 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	OLFM4	Q6UX06	510 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	SYT17	Q9BSW7	474 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TCL6-204	ENST00000460130	CHGB	P05060	677 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	GPSM2	P81274	684 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	LPIN2	Q92539	896 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	MED23	Q9ULK4	1368 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130		A0A0D9SFI3	127 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	C21orf2	O43822	256 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	REC8	O95072	547 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	FAM227B	Q96M60	508 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	BCS1L	Q9Y276	419 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	PHKA1	P46020	1223 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	KCNJ4	P48050	445 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	TICAM2	Q86XR7	235 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	MPND	Q8N594	471 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	XDH	P47989	1333 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	HIP1	O00291	1037 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	ATP2B4	P23634	1241 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	MCAM	P43121	646 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	ZAP70	P43403	619 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	SLC4A3	P48751	1232 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	PTH1R	Q03431	593 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	CCDC102B	Q68D86	513 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	FSD1	Q9BTV5	496 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	PALD1	Q9ULE6	856 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	RAD50	Q92878	1312 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	LTBP1	Q14766	1721 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	GOLIM4	O00461	696 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	SLC5A1	P13866	664 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	UBE4A	Q14139	1066 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	CCDC93	Q567U6	631 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	PI16	Q6UXB8	463 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	KCNB2	Q92953	911 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	SNX21	Q969T3	373 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	GGA1	Q9UJY5	639 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		14.65	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	C6orf229	H3BNL8	230 aa		14.65	□□□□□ -0.06
TCL6-204	ENST00000460130	UFL1	O94874	794 aa		14.65	□□□□□ -0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms