RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758		Q6ZUG5	572 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM89A	Q96GI7	184 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	ZMYM6	O95789	1325 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	TOM1	O60784	492 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	PDE8B	O95263	885 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	CAVIN2	O95810	425 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	CLCN1	P35523	988 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	TRDN	Q13061	729 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	LPIN2	Q92539	896 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	SCN7A	Q01118	1682 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	MAST3	O60307	1309 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	SYCE3	A1L190	88 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	IGSF3	O75054	1194 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	WASHC4	Q2M389	1173 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	SLIT2	O94813	1529 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	ESPN	B1AK53	854 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	LARGE1	O95461	756 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	CPA1	P15085	419 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	EVC	P57679	992 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758		E7EWF7	191 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF213	O14771	459 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	FIBP	O43427	364 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	CDKL5	O76039	1030 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	GNAT2	P19087	354 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP3K12	Q12852	859 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	MYH6	P13533	1939 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	NHS	Q6T4R5	1651 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	TPM3	P06753	285 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP6V1A	P38606	617 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	SIK1	P57059	783 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	BRF1	Q92994	677 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA32	Q96LK8	384 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	MTA3	Q9BTC8	594 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	C4A	P0C0L4	1744 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	C4B	P0C0L5	1744 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	CTAGE5	O15320	804 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	GPT	P24298	496 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	ADD2	P35612	726 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	ALX1	Q15699	326 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	HLF	Q16534	295 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	RBSN	Q9H1K0	784 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	GREM2	Q9H772	168 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-222	ENST00000459758	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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