RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PHKA1P46020 1223 aa18.46■□□□□ 0.55
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.46■□□□□ 0.55
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLX4Q8IY92 1834 aa18.46■□□□□ 0.55
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYH7P12883 1935 aa18.43■□□□□ 0.54
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP18.43■□□□□ 0.54
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GYG1P46976 350 aa18.42■□□□□ 0.54
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SCARF1Q14162 830 aa18.42■□□□□ 0.54
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SNRKQ9NRH2 765 aa18.42■□□□□ 0.54
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa18.42■□□□□ 0.54
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.42■□□□□ 0.54
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLC51AQ86UW1 340 aa18.4■□□□□ 0.54
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.4■□□□□ 0.54
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.4■□□□□ 0.54
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KLRK1P26718 216 aa18.39■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PTGER2P43116 358 aa18.39■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PI16Q6UXB8 463 aa18.39■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF804AQ7Z570 1209 aa18.39■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TTLL6Q8N841 843 aa18.39■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 POLLQ9UGP5 575 aa18.39■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DENND2AQ9ULE3 1009 aa18.39■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CD2APQ9Y5K6 639 aa18.39■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DOCK2Q92608 1830 aa18.39■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 REC8O95072 547 aa18.38■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GRIPAP1Q4V328 841 aa18.38■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ANTXR1Q9H6X2 564 aa18.38■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPON1Q9HCB6 807 aa18.38■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MED23Q9ULK4 1368 aa18.38■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KCNA3P22001 575 aa18.37■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TXNRD3Q86VQ6 643 aa18.37■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C7orf43Q8WVR3 580 aa18.37■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.532e-12■■■□□ 14.7
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SGSM2O43147 1006 aa18.36■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa18.36■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RAD50Q92878 1312 aa18.36■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EYA3Q99504 573 aa18.36■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DUOX1Q9NRD9 1551 aa18.36■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PIM2Q9P1W9 311 aa18.36■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
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