RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 SCN9AQ15858 1988 aa19.64■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 EYA2O00167 538 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 VIL1P09327 827 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 ATG9AQ7Z3C6 839 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 FSTL1Q12841 308 aa19.62■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 UBE4AQ14139 1066 aa19.62■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 METTL24Q5JXM2 366 aa19.62■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 SHTN1A0MZ66 631 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 MS4A1P11836 297 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 SMC1BQ8NDV3 1235 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 DPF2Q92785 391 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 SIL1Q9H173 461 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 COPRSQ9NQ92 184 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 USP17L3A6NCW0 530 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 USP17L4A6NCW7 530 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 SRGAP3O43295 1099 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 CIAO1O76071 339 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 PDE8BO95263 885 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 USP17L1Q7RTZ2 530 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 CD209Q9NNX6 404 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 FBXO3Q9UK99 471 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 RPS12P25398 132 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 CHADLQ6NUI6 762 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 LDHDQ86WU2 507 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 C1orf115Q9H7X2 142 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-206ENST00000443528 IL1R1P14778 569 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 FGFR2P21802 821 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 MVPQ14764 893 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 DACT2Q5SW24 774 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 ZNF804AQ7Z570 1209 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 MICALL2Q8IY33 904 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 GMLQ99445 158 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 COG6Q9Y2V7 657 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 ZNF609O15014 1411 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 GYG1P46976 350 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 STRIP1Q5VSL9 837 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 MXD3Q9BW11 206 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 PSME4Q14997 1843 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 HSPA6P17066 643 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 IL15P40933 162 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 ATP8B2P98198 1209 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 POLA2Q14181 598 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 TTLL5Q6EMB2 1281 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 AGBL3Q8NEM8 1001 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 TRPM4Q8TD43 1214 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 CLEC11AQ9Y240 323 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 H7C1D1 291 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 EGFRP00533 1210 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 GTF2IP78347 998 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 PDE3AQ14432 1141 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 FBXO33Q7Z6M2 555 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 FBXW7Q969H0 707 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 CEP126Q9P2H0 1117 aa19.55■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 SAMD7Q7Z3H4 446 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 SSH3Q8TE77 659 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 LPIN2Q92539 896 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 DDX19BQ9UMR2 479 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 BCAMP50895 628 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 CEP85Q6P2H3 762 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 PGAP2Q9UHJ9 254 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
ACTB-206ENST00000443528 MYO3BQ8WXR4 1341 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-206ENST00000443528 SASH1O94885 1247 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-206ENST00000443528 USP17L8P0C7I0 530 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-206ENST00000443528 SLC5A1P13866 664 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-206ENST00000443528 ATP2B3Q16720 1220 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-206ENST00000443528 CAVIN4Q5BKX8 364 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-206ENST00000443528 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
ACTB-206ENST00000443528 CNTROBQ8N137 903 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-206ENST00000443528 CERS5Q8N5B7 392 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-206ENST00000443528 JAG2Q9Y219 1238 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-206ENST00000443528 TFCP2Q12800 502 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-206ENST00000443528 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-206ENST00000443528 FAM205AQ6ZU69 1335 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-206ENST00000443528 PASKQ96RG2 1323 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-206ENST00000443528 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
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