RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.38□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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CBX1P4-201ENST00000439415 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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CBX1P4-201ENST00000439415 C2orf27AQ580R0 203 aa6.36□□□□□ -1.39
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CBX1P4-201ENST00000439415 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.36□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 FERMT3Q86UX7 667 aa6.36□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.36□□□□□ -1.39
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CBX1P4-201ENST00000439415 CEP44Q9C0F1 390 aa6.36□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCB6Q9NP58 842 aa6.36□□□□□ -1.39
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CBX1P4-201ENST00000439415 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.35□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.35□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 CELA3AP09093 270 aa6.34□□□□□ -1.39
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CBX1P4-201ENST00000439415 FXNQ16595 210 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 MTERF2Q49AM1 385 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 ITPKCQ96DU7 683 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 ZIC5Q96T25 663 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 IER2Q9BTL4 223 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC3Q9BY71 257 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 PHKA2P46019 1235 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF165P49910 485 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 TBX4P57082 545 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNC4Q03721 635 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 TKFCQ3LXA3 575 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 SMC5Q8IY18 1101 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 JMYQ8N9B5 988 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 ALDH1A1P00352 501 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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