RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438067.5

PTCH2-202, Transcript of patched 2, humanhuman

TSL 3

Gene PTCH2, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH2-202ENST00000438067 SLC34A2O95436 690 aa22.25■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.25■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 DACT2Q5SW24 774 aa22.25■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 MOB2Q70IA6 237 aa22.25■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 MXD3Q9BW11 206 aa22.25■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 STK31Q9BXU1 1019 aa22.25■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.24■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 H7C1W4 665 aa22.24■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.24■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.23■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 G2E3Q7L622 706 aa22.23■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.23■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 OGFOD1Q8N543 542 aa22.23■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 COA1Q9GZY4 146 aa22.23■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.22■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.22■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.22■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 WNT10BO00744 389 aa22.21■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 SLC4A2P04920 1241 aa22.21■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 FBXW7Q969H0 707 aa22.21■■□□□ 1.15
PTCH2-202ENST00000438067 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.2■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 GCKRQ14397 625 aa22.19■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 CCDC27Q2M243 656 aa22.19■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 WWC1Q8IX03 1113 aa22.19■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.19■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.18■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.18■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 ITGA6P23229 1130 aa22.18■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 MMP14P50281 582 aa22.18■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 CCDC184Q52MB2 194 aa22.18■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.18■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.18■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 PSME4Q14997 1843 aa22.17■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 SASH1O94885 1247 aa22.17■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 CSF1RP07333 972 aa22.17■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 KLRK1P26718 216 aa22.17■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 CASP7P55210 303 aa22.17■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 TBC1D8O95759 1140 aa22.16■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 NF2P35240 595 aa22.16■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 SOX10P56693 466 aa22.16■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.16■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 TM4SF4P48230 202 aa22.15■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 FLIIQ13045 1269 aa22.15■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.15■■□□□ 1.14
PTCH2-202ENST00000438067 GTF2IP78347 998 aa22.14■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 LINS1Q8NG48 757 aa22.14■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.14■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.14■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.14■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.14■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 IL16Q14005 1332 aa22.13■■□□□ 1.13
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PTCH2-202ENST00000438067 CHRNDQ07001 517 aa22.13■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 KCNJ4P48050 445 aa22.12■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.12■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 CD209Q9NNX6 404 aa22.12■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 PRKG1Q13976 671 aa22.11■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.11■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.11■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.1■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 SNAP23O00161 211 aa22.1■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 GPR25O00155 361 aa22.09■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 SREBF2Q12772 1141 aa22.09■■□□□ 1.13
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PTCH2-202ENST00000438067 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.08■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 VAMP4O75379 141 aa22.08■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 TAF5LO75529 589 aa22.08■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 FOXO4P98177 505 aa22.08■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 DLGAP5Q15398 846 aa22.08■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 CERS5Q8N5B7 392 aa22.08■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.08■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTCH2-202ENST00000438067 MYH3P11055 1940 aa22.08■■□□□ 1.12
PTCH2-202ENST00000438067 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.07■■□□□ 1.12
PTCH2-202ENST00000438067 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.07■■□□□ 1.12
PTCH2-202ENST00000438067 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTCH2-202ENST00000438067 SPRYD7Q5W111 196 aa22.07■■□□□ 1.12
PTCH2-202ENST00000438067 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTCH2-202ENST00000438067 SPEF2Q9C093 1822 aa22.06■■□□□ 1.12
PTCH2-202ENST00000438067 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.06■■□□□ 1.12
PTCH2-202ENST00000438067 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.06■■□□□ 1.12
PTCH2-202ENST00000438067 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.06■■□□□ 1.12
PTCH2-202ENST00000438067 FZD1Q9UP38 647 aa22.06■■□□□ 1.12
PTCH2-202ENST00000438067 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.05■■□□□ 1.12
PTCH2-202ENST00000438067 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.05■■□□□ 1.12
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