RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429990.1

NPIPB15-201, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NPIPB15, Length 1,428 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15-201ENST00000429990 MFSD10Q14728 455 aa8.97□□□□□ -0.97
NPIPB15-201ENST00000429990 GREM2Q9H772 168 aa8.97□□□□□ -0.97
NPIPB15-201ENST00000429990 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.97□□□□□ -0.97
NPIPB15-201ENST00000429990 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.97□□□□□ -0.97
NPIPB15-201ENST00000429990 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
NPIPB15-201ENST00000429990 XDHP47989 1333 aa8.96□□□□□ -0.97
NPIPB15-201ENST00000429990 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.96□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 ITGA6P23229 1130 aa8.96□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 PDE4AP27815 886 aa8.96□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 FSTL1Q12841 308 aa8.96□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 WASHC4Q2M389 1173 aa8.96□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 CCDC57Q2TAC2 916 aa8.96□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 MPHOSPH8Q99549 860 aa8.96□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.96□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 ANKRD2Q9GZV1 360 aa8.96□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.96□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 GGA1Q9UJY5 639 aa8.96□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 ZNRF3Q9ULT6 936 aa8.96□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 DUOX1Q9NRD9 1551 aa8.95□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 C6orf229H3BNL8 230 aa8.95□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 ATP2B4P23634 1241 aa8.95□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 GPSM2P81274 684 aa8.95□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 FOXO4P98177 505 aa8.95□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 TNIP1Q15025 636 aa8.95□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 AOC3Q16853 763 aa8.95□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 FAM161AQ3B820 660 aa8.95□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 SPEF2Q9C093 1822 aa8.94□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 UFL1O94874 794 aa8.94□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 TAF7LQ5H9L4 462 aa8.94□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 LMBR1LQ6UX01 489 aa8.94□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa8.94□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.94□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 TBC1D16Q8TBP0 767 aa8.94□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 RRAGCQ9HB90 399 aa8.94□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 POLLQ9UGP5 575 aa8.94□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 MINPP1Q9UNW1 487 aa8.94□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.94□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 DDNO94850 711 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 USP44Q9H0E7 712 aa8.93□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 HACL1Q9UJ83 578 aa8.93□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.93□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.93□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 MED23Q9ULK4 1368 aa8.93□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 COL4A1P02462 1669 aa8.92□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 COL4A5P29400 1685 aa8.92□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 G3V3G9 751 aa8.92□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 GNAI3P08754 354 aa8.92□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 PLCG2P16885 1265 aa8.92□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 RPS12P25398 132 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 NBR1Q14596 966 aa8.92□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 E2F4Q16254 413 aa8.92□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.92□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.92□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.92□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 ZNF609O15014 1411 aa8.92□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 MS4A1P11836 297 aa8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 TRIM27P14373 513 aa8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 KCNJ4P48050 445 aa8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 MMP14P50281 582 aa8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 CXCL9Q07325 125 aa8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 PODNQ7Z5L7 613 aa8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 LDHDQ86WU2 507 aa8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 DPF2Q92785 391 aa8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 SUCLG2Q96I99 432 aa8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 PSME4Q14997 1843 aa8.91□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 POTECB2RU33 542 aa8.9□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 ECE2O60344 883 aa8.9□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 HSPA6P17066 643 aa8.9□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 EPHX2P34913 555 aa8.9□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 CHRNDQ07001 517 aa8.9□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.9□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 SLC51AQ86UW1 340 aa8.9□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 SLC39A7Q92504 469 aa8.9□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 KAZALD1Q96I82 304 aa8.9□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 COA1Q9GZY4 146 aa8.9□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 GPRC5DQ9NZD1 345 aa8.9□□□□□ -0.98
NPIPB15-201ENST00000429990 METRNQ9UJH8 293 aa8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms