RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429794.1

CITED1-205, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-205ENST00000429794 MMP14P50281 582 aa15.89■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 SCARF1Q14162 830 aa15.89■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 PLA2G12BQ9BX93 195 aa15.89■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 MYO3BQ8WXR4 1341 aa15.89■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 CCDC85CA6NKD9 419 aa15.88■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 RGS19P49795 217 aa15.88■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 MCOLN1Q9GZU1 580 aa15.88■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 COA1Q9GZY4 146 aa15.88■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 LEMD3Q9Y2U8 911 aa15.88■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 SLC4A2P04920 1241 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 STRIP1Q5VSL9 837 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 MRS2Q9HD23 443 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 FLIIQ13045 1269 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 GCKRQ14397 625 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 FAM161AQ3B820 660 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 DACT2Q5SW24 774 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 G2E3Q7L622 706 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 OGFOD1Q8N543 542 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 ANKRD2Q9GZV1 360 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 DGKZQ13574 1117 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 CCDC184Q52MB2 194 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 RASAL3Q86YV0 1011 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 LINS1Q8NG48 757 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 CSF1RP07333 972 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 ITGA6P23229 1130 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 CASP7P55210 303 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 DNAAF4Q8WXU2 420 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 CSRNP1Q96S65 589 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 MPHOSPH8Q99549 860 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 RNF186Q9NXI6 227 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 ZNF804BA4D1E1 1349 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 A0A1B0GUL6 1792 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 ECM29Q5VYK3 1845 aa15.82■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 WNT10BO00744 389 aa15.82■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 TRPA1O75762 1119 aa15.82■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 NBPF9Q3BBW0 867 aa15.82■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.82■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 WDR63Q8IWG1 891 aa15.82■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 NF2P35240 595 aa15.81■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 TTLL5Q6EMB2 1281 aa15.81■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 FBXW7Q969H0 707 aa15.81■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.81■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa15.8■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 VAMP4O75379 141 aa15.8■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 KCNJ4P48050 445 aa15.8■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 CHRNDQ07001 517 aa15.8■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 MXD3Q9BW11 206 aa15.8■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 KLRK1P26718 216 aa15.79■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 CD209Q9NNX6 404 aa15.78■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 IRS2Q9Y4H2 1338 aa15.77■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.77■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 SASH1O94885 1247 aa15.77■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 GTF2IP78347 998 aa15.77■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa15.77■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 MOB2Q70IA6 237 aa15.77■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 KIAA0825Q8IV33 1275 aa15.77■□□□□ 0.12
CITED1-205ENST00000429794 LAMB1P07942 1786 aa15.77■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 TM4SF4P48230 202 aa15.76■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 FOXO4P98177 505 aa15.76■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 BEND3Q5T5X7 828 aa15.76■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 ARMC9Q7Z3E5 817 aa15.76■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 MTMR14Q8NCE2 650 aa15.76■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 IL1R1P14778 569 aa15.75■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 SREBF2Q12772 1141 aa15.75■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.75■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa15.75■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa15.75■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 DLGAP5Q15398 846 aa15.74■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.74■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 F6X3S4 739 aa15.73■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 GRM8O00222 908 aa15.73■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 TAF5LO75529 589 aa15.73■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 CCDC57Q2TAC2 916 aa15.73■□□□□ 0.11
CITED1-205ENST00000429794 LDLRAD1Q5T700 205 aa15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms