RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.58■■□□□ 1.37
UPK3BP1-201ENST00000428678 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.57■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 MXD3Q9BW11 206 aa23.57■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.57■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 OGFOD1Q8N543 542 aa23.56■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.56■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 GREM2Q9H772 168 aa23.56■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.55■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 IGKV5-2P06315 115 aa23.55■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 DACT2Q5SW24 774 aa23.55■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 KSR2Q6VAB6 950 aa23.55■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.55■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.54■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 TSPYL6Q8N831 410 aa23.54■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.54■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 TBC1D8O95759 1140 aa23.53■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 NF2P35240 595 aa23.53■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.53■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 WNT10BO00744 389 aa23.52■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.52■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 COA1Q9GZY4 146 aa23.52■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.52■■□□□ 1.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 SASH1O94885 1247 aa23.51■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 STK31Q9BXU1 1019 aa23.51■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.5■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.5■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.5■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.49■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 TM4SF4P48230 202 aa23.48■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRKG1Q13976 671 aa23.48■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.48■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.47■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.47■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.47■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 H7C1W4 665 aa23.46■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 GPR25O00155 361 aa23.46■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 KLRK1P26718 216 aa23.46■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 MMP14P50281 582 aa23.46■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 SREBF2Q12772 1141 aa23.46■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.46■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.46■■□□□ 1.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 ITGA6P23229 1130 aa23.45■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 KCNJ4P48050 445 aa23.45■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 GTF2IP78347 998 aa23.45■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 G2E3Q7L622 706 aa23.45■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.44■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC4A2P04920 1241 aa23.43■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 GCKRQ14397 625 aa23.43■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.42■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 FKTNO75072 461 aa23.41■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPRYD7Q5W111 196 aa23.41■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 CHRNDQ07001 517 aa23.4■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 DLGAP5Q15398 846 aa23.4■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.4■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.4■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.4■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 FZD1Q9UP38 647 aa23.4■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 CSF1RP07333 972 aa23.39■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 FLIIQ13045 1269 aa23.39■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.39■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.39■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 CD209Q9NNX6 404 aa23.39■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 HTTP42858 3142 aa23.38■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 CASP7P55210 303 aa23.38■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.37■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 SNAP23O00161 211 aa23.37■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 ALDH1A1P00352 501 aa23.37■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.37■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.37■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 WWC1Q8IX03 1113 aa23.36■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 CERS5Q8N5B7 392 aa23.36■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 LINS1Q8NG48 757 aa23.36■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.36■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 F8W031 263 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 TAF5LO75529 589 aa23.35■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC27Q2M243 656 aa23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms