RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 POLLQ9UGP5 575 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 GRIN3BO60391 1043 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 XAGE2Q96GT9 111 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 KLRK1P26718 216 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 ADORA1P30542 326 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 MED23Q9ULK4 1368 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 GORABQ5T7V8 394 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 PSMD1Q99460 953 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 EYA3Q99504 573 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 CHD4Q14839 1912 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 WASHC4Q2M389 1173 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXA4-202ENST00000428284 RIMBP2O15034 1052 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 GYG1P46976 350 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 SBF1O95248 1867 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 NFKBIEO00221 500 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 VPS37DQ86XT2 251 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 MX1P20591 662 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 PDE4AP27815 886 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 SKAP1Q86WV1 359 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 GPATCH3Q96I76 525 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 PPIP5K2O43314 1243 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 BCAMP50895 628 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 RASSF7Q02833 373 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 AOC3Q16853 763 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC102BQ68D86 513 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 PHKA1P46020 1223 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 G3V3G9 751 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 RGS3P49796 1198 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-202ENST00000428284 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 PDE1AP54750 535 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 UTRNP46939 3433 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 DOK7Q18PE1 504 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 AK9Q5TCS8 1911 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 VPS33BQ9H267 617 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 COA1Q9GZY4 146 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 SCN9AQ15858 1988 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 ERC2O15083 957 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 CD209Q9NNX6 404 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 STAP2Q9UGK3 403 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 COL4A5P29400 1685 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 PSME4Q14997 1843 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 ECE2O60344 883 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 ATP5JP18859 108 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 AOX1Q06278 1338 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 NIM1KQ8IY84 436 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXA4-202ENST00000428284 IL1R1P14778 569 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXA4-202ENST00000428284 MCAMP43121 646 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXA4-202ENST00000428284 RASGRF1Q13972 1273 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXA4-202ENST00000428284 SCARF1Q14162 830 aa25.14■■□□□ 1.61
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