RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
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PMS1-205ENST00000409985 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.13■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 AGXT2Q9BYV1 514 aa28.13■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 A1BGP04217 495 aa28.12■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.12■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.12■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 ABCC12Q96J65 1359 aa28.12■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
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PMS1-205ENST00000409985 CHMP3Q9Y3E7 222 aa28.11■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 TCIRG1Q13488 830 aa28.1■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 Q6ZUG5 572 aa28.1■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 FBXL16Q8N461 479 aa28.1■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa28.1■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.1■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 PFKFB2O60825 505 aa28.1■■■□□ 2.09
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PMS1-205ENST00000409985 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.1■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.1■■■□□ 2.09
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PMS1-205ENST00000409985 KIF3AQ9Y496 699 aa28.09■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 TCEANC2Q96MN5 208 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
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PMS1-205ENST00000409985 PLSCR1O15162 318 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 KDM4AO75164 1064 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 CCDC192P0DO97 292 aa28.08■■■□□ 2.09
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PMS1-205ENST00000409985 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
PMS1-205ENST00000409985 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
PMS1-205ENST00000409985 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
PMS1-205ENST00000409985 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.07■■■□□ 2.08
PMS1-205ENST00000409985 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
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PMS1-205ENST00000409985 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PMS1-205ENST00000409985 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PMS1-205ENST00000409985 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PMS1-205ENST00000409985 TIMM10P62072 90 aa28.06■■■□□ 2.08
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.06■■■□□ 2.08
PMS1-205ENST00000409985 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PMS1-205ENST00000409985 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.06■■■□□ 2.08
PMS1-205ENST00000409985 LAMA4Q16363 1823 aa28.06■■■□□ 2.08
PMS1-205ENST00000409985 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
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PMS1-205ENST00000409985 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.02■■■□□ 2.08
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PMS1-205ENST00000409985 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.02■■■□□ 2.08
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PMS1-205ENST00000409985 SCRN1Q12765 414 aa28.01■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 FGD1P98174 961 aa28■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 AMIGO3Q86WK7 504 aa28■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 E7EWF7 191 aa28■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 H3BQV1 296 aa28■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 STARD3NLO95772 234 aa28■■■□□ 2.07
PMS1-205ENST00000409985 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28■■■□□ 2.07
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