RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC57Q2TAC2 916 aa35.12■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 KRT26Q7Z3Y9 468 aa35.12■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 SAPCD2Q86UD0 394 aa35.12■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 USP48Q86UV5 1035 aa35.12■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 KCNJ4P48050 445 aa35.11■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 EPHA10Q5JZY3 1008 aa35.11■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 AIDAQ96BJ3 306 aa35.11■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 HHIPL1Q96JK4 782 aa35.11■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 CAPNS2Q96L46 248 aa35.11■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 STRIP1Q5VSL9 837 aa35.1■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 TXNRD3Q86VQ6 643 aa35.1■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 WBP1LQ9NX94 342 aa35.1■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 MYO3BQ8WXR4 1341 aa35.09■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 SSH1Q8WYL5 1049 aa35.09■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF408Q9H9D4 720 aa35.09■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 UTYO14607 1347 aa35.08■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 DACT2Q5SW24 774 aa35.08■■■■□ 3.21
ANKRD54-203ENST00000407117 ALDH1L2Q3SY69 923 aa35.07■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 TAF7LQ5H9L4 462 aa35.07■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 MYOZ2Q9NPC6 264 aa35.07■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 GGA3Q9NZ52 723 aa35.07■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 FOXN1O15353 648 aa35.06■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 MMP14P50281 582 aa35.06■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 CYP4F22Q6NT55 531 aa35.06■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 SULF1Q8IWU6 871 aa35.06■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 CDCA7LQ96GN5 454 aa35.06■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 KLRK1P26718 216 aa35.05■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa35.05■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 THSD7BQ9C0I4 1608 aa35.05■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 OGFOD1Q8N543 542 aa35.04■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 SUCLG2Q96I99 432 aa35.04■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 SCARF1Q14162 830 aa35.03■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 ADM5C9JUS6 153 aa35.02■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 TAF5LO75529 589 aa35.02■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 TTLL5Q6EMB2 1281 aa35.02■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 FBXW7Q969H0 707 aa35.02■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 KAZALD1Q96I82 304 aa35.02■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 CNNM1Q9NRU3 951 aa35.02■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa35.02■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 IRS2Q9Y4H2 1338 aa35.02■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 MAP2K2P36507 400 aa35.01■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 GRM1Q13255 1194 aa35.01■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 CD209Q9NNX6 404 aa35.01■■■■□ 3.2
ANKRD54-203ENST00000407117 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 TNS4Q8IZW8 715 aa35■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 PRDM10Q9NQV6 1147 aa35■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 DLK2Q6UY11 383 aa34.99■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 MXD3Q9BW11 206 aa34.99■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 SMC4Q9NTJ3 1288 aa34.99■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 SNAP23O00161 211 aa34.98■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF804AQ7Z570 1209 aa34.98■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 C2orf69Q8N8R5 385 aa34.98■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 HUNKP57058 714 aa34.97■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 GTF2IP78347 998 aa34.97■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 A0A1B0GUL6 1792 aa34.96■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 BEGAINQ9BUH8 593 aa34.95■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 HDAC9Q9UKV0 1011 aa34.95■■■■□ 3.19
ANKRD54-203ENST00000407117 IL1R1P14778 569 aa34.94■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 CDCA5Q96FF9 252 aa34.94■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 USP44Q9H0E7 712 aa34.93■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 PLIN1O60240 522 aa34.92■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 AOC2O75106 756 aa34.92■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 UBE4AQ14139 1066 aa34.92■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 NBPF9Q3BBW0 867 aa34.92■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 WNT10BO00744 389 aa34.91■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 NOGQ13253 232 aa34.91■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 KIAA0825Q8IV33 1275 aa34.91■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 ANKRD44Q8N8A2 993 aa34.91■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 MROH5Q6ZUA9 1318 aa34.9■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa34.9■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 LBX1P52954 281 aa34.89■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 RGMBQ6NW40 437 aa34.89■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
ANKRD54-203ENST00000407117 FKBP1BP68106 108 aa34.88■■■■□ 3.17
ANKRD54-203ENST00000407117 CA12O43570 354 aa34.86■■■■□ 3.17
ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC102AQ96A19 550 aa34.86■■■■□ 3.17
ANKRD54-203ENST00000407117 CERS5Q8N5B7 392 aa34.85■■■■□ 3.17
ANKRD54-203ENST00000407117 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
ANKRD54-203ENST00000407117 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
ANKRD54-203ENST00000407117 SASH1O94885 1247 aa34.84■■■■□ 3.17
ANKRD54-203ENST00000407117 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
ANKRD54-203ENST00000407117 MTMR14Q8NCE2 650 aa34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms