RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400824.8

AFDN-208, Transcript of afadin, adherens junction formation factor, human

TSL 5

Gene AFDN, Length 875 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFDN-208	ENST00000400824	KSR2	Q6VAB6	950 aa		33.84	■■■■□ 3.01
AFDN-208	ENST00000400824	TSPYL6	Q8N831	410 aa		33.84	■■■■□ 3.01
AFDN-208	ENST00000400824	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	33.84	■■■■□ 3.01
AFDN-208	ENST00000400824	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		33.83	■■■■□ 3.01
AFDN-208	ENST00000400824	MOB2	Q70IA6	237 aa		33.83	■■■■□ 3.01
AFDN-208	ENST00000400824	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
AFDN-208	ENST00000400824	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		33.83	■■■■□ 3.01
AFDN-208	ENST00000400824	GREM2	Q9H772	168 aa		33.83	■■■■□ 3.01
AFDN-208	ENST00000400824	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		33.82	■■■■□ 3
AFDN-208	ENST00000400824	DACT2	Q5SW24	774 aa		33.82	■■■■□ 3
AFDN-208	ENST00000400824	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		33.8	■■■■□ 3
AFDN-208	ENST00000400824	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	33.8	■■■■□ 3
AFDN-208	ENST00000400824	SOX10	P56693	466 aa		33.8	■■■■□ 3
AFDN-208	ENST00000400824	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		33.8	■■■■□ 3
AFDN-208	ENST00000400824	MXD3	Q9BW11	206 aa		33.8	■■■■□ 3
AFDN-208	ENST00000400824	WNT10B	O00744	389 aa		33.77	■■■■□ 3
AFDN-208	ENST00000400824	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		33.77	■■■■□ 3
AFDN-208	ENST00000400824	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
AFDN-208	ENST00000400824	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		33.77	■■■■□ 3
AFDN-208	ENST00000400824	OGFOD1	Q8N543	542 aa		33.77	■■■■□ 3
AFDN-208	ENST00000400824	COA1	Q9GZY4	146 aa		33.77	■■■■□ 3
AFDN-208	ENST00000400824	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		33.77	■■■■□ 3
AFDN-208	ENST00000400824	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		33.76	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		33.75	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824		H7C1W4	665 aa		33.74	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		33.74	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	MMP14	P50281	582 aa		33.73	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	33.73	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	FBXW7	Q969H0	707 aa		33.73	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	STK31	Q9BXU1	1019 aa		33.73	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	TM4SF4	P48230	202 aa		33.72	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		33.72	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	TBC1D8	O95759	1140 aa		33.71	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	33.71	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	G2E3	Q7L622	706 aa		33.71	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	SASH1	O94885	1247 aa		33.7	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	NF2	P35240	595 aa		33.7	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		33.7	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		33.7	■■■□□ 2.99
AFDN-208	ENST00000400824	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		33.69	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		33.69	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	KLRK1	P26718	216 aa		33.68	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		33.68	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		33.68	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	ITGA6	P23229	1130 aa		33.67	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	SLC4A2	P04920	1241 aa		33.66	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	GCKR	Q14397	625 aa		33.66	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	CASP7	P55210	303 aa		33.65	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		33.65	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	GPR25	O00155	361 aa		33.64	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	CSF1R	P07333	972 aa		33.64	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		33.64	■■■□□ 2.98
AFDN-208	ENST00000400824	GTF2I	P78347	998 aa		33.63	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	CCDC27	Q2M243	656 aa		33.63	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		33.63	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	CACNA1F	O60840	1977 aa		33.63	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	SREBF2	Q12772	1141 aa		33.62	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		33.62	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		33.62	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	PRKG1	Q13976	671 aa		33.61	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	CHRND	Q07001	517 aa		33.6	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	FLII	Q13045	1269 aa		33.6	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	WWC1	Q8IX03	1113 aa		33.6	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	CD209	Q9NNX6	404 aa		33.6	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		33.59	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		33.59	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	KCNJ4	P48050	445 aa		33.58	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	SPRYD7	Q5W111	196 aa		33.58	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		33.58	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		33.58	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		33.57	■■■□□ 2.97
AFDN-208	ENST00000400824	LINS1	Q8NG48	757 aa		33.57	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		33.57	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824		A0A1B0GUL6	1792 aa		33.57	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		33.56	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	IL16	Q14005	1332 aa		33.55	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	FKTN	O75072	461 aa		33.55	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	CCDC184	Q52MB2	194 aa		33.55	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	CERS5	Q8N5B7	392 aa		33.55	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		33.55	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	FZD1	Q9UP38	647 aa		33.55	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		33.54	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	SNAP23	O00161	211 aa		33.54	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	DLGAP5	Q15398	846 aa		33.54	■■■□□ 2.96
AFDN-208	ENST00000400824	MAP3K11	Q16584	847 aa		33.53	■■■□□ 2.96

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