RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 YDJCA8MPS7 323 aa18.98■□□□□ 0.63
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIL1Q9H173 461 aa18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 IRS2Q9Y4H2 1338 aa18.98■□□□□ 0.63
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM205AQ6ZU69 1335 aa18.87■□□□□ 0.61
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEMA3EO15041 775 aa18.86■□□□□ 0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB11FIP3O75154 756 aa18.86■□□□□ 0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCAMP50895 628 aa18.86■□□□□ 0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EPS15P42566 896 aa18.85■□□□□ 0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LDHDQ86WU2 507 aa18.85■□□□□ 0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MICALL2Q8IY33 904 aa18.85■□□□□ 0.61
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